Structural Basis for pH-Dependent Oligomerization of Dihydropyrimidinase from Pseudomonas aeruginosa PAO1

Table 2

The formation of hydrogen bonds at the dimer-dimer interface of P. aeruginosa dihydropyrimidinase.

Subunit 1	Distance [Å]	Subunit 2
A: K374 [NZ]	3.00	B: E14 [OE1]
A: H13 [NE2]	2.88	B: E14 [OE1]
A: R386 [NH2]	3.86	B: E14 [OE2]
A: R386 [NH1]	2.81	B: E15 [OE2]
A: R386 [NH2]	2.83	B: E15 [OE2]
A: R468 [NH2]	3.61	B: Q306 [OE1]
A: R253 [NH1]	3.27	B: S307 [O]
A: R253 [NH2]	3.13	B: S307 [O]
A: R467 [NH1]	2.92	B: V354 [O]
A: R468 [NE]	2.95	B: G357 [O]
A: R468 [NH2]	3.09	B: G357 [O]
A: R468 [NH2]	3.40	B: R358 [O]
A: R467 [NH1]	3.24	B: L359 [O]
A: E14 [OE1]	3.09	B: K374 [NZ]
A: E14 [OE1]	2.47	B: H13 [NE2]
A: E15 [OE2]	2.70	B: R386 [NH1]
A: S307 [O]	3.30	B: R253 [NH1]
A: S307 [O]	3.55	B: R253 [NH2]
A: V354 [O]	2.91	B: R467 [NH1]
A: G357 [O]	2.94	B: R468 [NH2]
A: G357 [O]	2.94	B: R468 [NE]
A: R358 [O]	3.56	B: R468 [NH2]
A: L359 [O]	3.16	B: R467 [NH1]
C′: H13 [NE2]	2.79	D′: E14 [OE1]
C′: K374 [NZ]	3.25	D′: E14 [OE1]
C′: R386 [NH1]	2.85	D′: E15 [OE1]
C′: R386 [NH2]	2.59	D′: E15 [OE2]
C′: R468 [NH2]	3.26	D′: Q306 [OE1]
C′: R253 [NH1]	3.13	D′: S307 [O]
C′: R253 [NH2]	3.16	D′: S307 [O]
C′: R468 [NE]	2.71	D′: G357 [O]
C′: R468 [NH2]	3.11	D′: R358 [O]
C′: E14 [OE1]	2.88	D′: H13 [NE2]
C′: E14 [OE1]	2.89	D′: K374 [NZ]
C′: E15 [OE2]	2.88	D′: R386 [NH1]
C′: E15 [OE2]	2.73	D′: R386 [NH2]
C′: Q306 [OE1]	3.53	D′: R468 [NH2]
C′: S307 [O]	3.21	D′: R253 [NH1]
C′: S307 [O]	3.59	D′: R253 [NH2]
C′: G357 [O]	2.65	D′: R468 [NE]
C′: R358 [O]	3.33	D′: R468 [NH2]