Research Article
Structural Basis for pH-Dependent Oligomerization of Dihydropyrimidinase from Pseudomonas aeruginosa PAO1
Table 2
The formation of hydrogen bonds at the dimer-dimer interface of P. aeruginosa dihydropyrimidinase.
| Subunit 1 | Distance [Å] | Subunit 2 |
| A: K374 [NZ] | 3.00 | B: E14 [OE1] | A: H13 [NE2] | 2.88 | B: E14 [OE1] | A: R386 [NH2] | 3.86 | B: E14 [OE2] | A: R386 [NH1] | 2.81 | B: E15 [OE2] | A: R386 [NH2] | 2.83 | B: E15 [OE2] | A: R468 [NH2] | 3.61 | B: Q306 [OE1] | A: R253 [NH1] | 3.27 | B: S307 [O] | A: R253 [NH2] | 3.13 | B: S307 [O] | A: R467 [NH1] | 2.92 | B: V354 [O] | A: R468 [NE] | 2.95 | B: G357 [O] | A: R468 [NH2] | 3.09 | B: G357 [O] | A: R468 [NH2] | 3.40 | B: R358 [O] | A: R467 [NH1] | 3.24 | B: L359 [O] | A: E14 [OE1] | 3.09 | B: K374 [NZ] | A: E14 [OE1] | 2.47 | B: H13 [NE2] | A: E15 [OE2] | 2.70 | B: R386 [NH1] | A: S307 [O] | 3.30 | B: R253 [NH1] | A: S307 [O] | 3.55 | B: R253 [NH2] | A: V354 [O] | 2.91 | B: R467 [NH1] | A: G357 [O] | 2.94 | B: R468 [NH2] | A: G357 [O] | 2.94 | B: R468 [NE] | A: R358 [O] | 3.56 | B: R468 [NH2] | A: L359 [O] | 3.16 | B: R467 [NH1] | C′: H13 [NE2] | 2.79 | D′: E14 [OE1] | C′: K374 [NZ] | 3.25 | D′: E14 [OE1] | C′: R386 [NH1] | 2.85 | D′: E15 [OE1] | C′: R386 [NH2] | 2.59 | D′: E15 [OE2] | C′: R468 [NH2] | 3.26 | D′: Q306 [OE1] | C′: R253 [NH1] | 3.13 | D′: S307 [O] | C′: R253 [NH2] | 3.16 | D′: S307 [O] | C′: R468 [NE] | 2.71 | D′: G357 [O] | C′: R468 [NH2] | 3.11 | D′: R358 [O] | C′: E14 [OE1] | 2.88 | D′: H13 [NE2] | C′: E14 [OE1] | 2.89 | D′: K374 [NZ] | C′: E15 [OE2] | 2.88 | D′: R386 [NH1] | C′: E15 [OE2] | 2.73 | D′: R386 [NH2] | C′: Q306 [OE1] | 3.53 | D′: R468 [NH2] | C′: S307 [O] | 3.21 | D′: R253 [NH1] | C′: S307 [O] | 3.59 | D′: R253 [NH2] | C′: G357 [O] | 2.65 | D′: R468 [NE] | C′: R358 [O] | 3.33 | D′: R468 [NH2] |
|
|