Bioimaging of Nucleolin Aptamer-Containing 5-(N-benzylcarboxyamide)-2′-deoxyuridine More Capable of Specific Binding to Targets in Cancer Cells

Table 1

A list of AS1411 compounds containing 5-(N-benzylcarboxyamide)-2^-deoxyuridine.

Comp. No.	Sequence (5^→3^)	Calculated Mass	Observed Mass	Fold   ratio	P-value
1	Cy3-labeled-ZTTGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG	9811.71	9812.32	1.12	.59
2	Cy3-labeled-TZTGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG	9811.71	9811.72	1.04	.58
3	Cy3-labeled-TTZGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG	9811.71	9811.92	1.07	.66
4	Cy3-labeled-TTTGGZGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG	9811.71	9812.27	1.62	.06
5	Cy3- labeled-TTTGGTGGZGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG	9811.71	9811.83	1.27	.19
6	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGZGGTTGTGGTGGTGGTGG	9811.71	9812.38	1.94	.07
7	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGZTGTGGTGGTGGTGG	9811.71	9812.18	0.62	.01
8	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGTZGTGGTGGTGGTGG	9811.71	9812.22	0.97	.74
9	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGTTGZGGTGGTGGTGG	9811.71	9812.01	0.96	.86
10	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGTTGTGGZGGTGGTGG	9811.71	9812.1	0.6	.02
11	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGZGGTGG	9811.71	9812.69	1.2	.39
12	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGZGG	9811.71	9811.78	2.44	∗∗
13	Cy3- labeled-TZZGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG	9930.82	9931.4	0.81	.11
14	Cy3- labeled-ZZZGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG	9930.82	9931.24	1.04	.79
15	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGZGGZGG	9930.82	9931.02	0.89	.56
16	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGTTGTGGZGGTGGZGG	9930.82	9931.1	0.86	.02
17	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGTTGZGGTGGTGGZGG	9930.82	9931.81	0.95	.8
18	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGTZGTGGTGGTGGZGG	9930.82	9930.93	1.07	.83
19	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGZTGTGGTGGTGGZGG	9930.82	∗N/A	0.65	.14
20	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGZGGTTGTGGTGGTGGZGG	9930.82	N/A	0.79	∗∗
21	Cy3- labeled-TTTGGTGGZGGTGGTTGTGGTGGTGGZGG	9930.82	N/A	1.57	.17
22	Cy3- labeled-TTTGGZGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGZGG	9930.82	9931.81	1.39	.16
23	Cy3- labeled-TTZGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGZGG	9930.82	N/A	0.94	.51
24	Cy3- labeled-TZTGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGZGG	9930.82	N/A	0.7	.03
25	Cy3- labeled-ZTTGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGZGG	9930.82	N/A	0.65	∗∗
26	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGZZGTGGTGGTGGZGG	10049.93	N/A	0.09	∗∗
27	Cy3- labeled-TZZGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGZGG	10049.93	N/A	0.06	∗∗
28	Cy3- labeled-ZZTGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGZGG	10049.93	10051.4	1.42	.02
29	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGZZGTGGTGGTGGTGG	9930.82	N/A	1.62	.02
30	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGZZGZGGTGGTGGTGG	10049.93	N/A	1.04	.27
31	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGZZGTGGZGGTGGTGG	10049.93	N/A	1.37	.1
32	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGZZGTGGTGGZGGTGG	10049.93	N/A	1.32	.05
33	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGZGGZZGTGGTGGTGGTGG	10049.93	N/A	1.19	.41
34	Cy3- labeled-TTTGGTGGZGGTGGZZGTGGTGGTGGTGG	10049.93	N/A	1.03	.12
35	Cy3- labeled-TTTGGZGGTGGTGGZZGTGGTGGTGGTGG	10049.93	10050.99	1.2	∗∗
36	Cy3- labeled-TTZGGTGGTGGTGGZZGTGGTGGTGGTGG	10049.93	N/A	1.11	.26
37	Cy3- labeled-TZTGGTGGTGGTGGZZGTGGTGGTGGTGG	10049.93	N/A	1.43	.06
38	Cy3- labeled-ZTTGGTGGTGGTGGZZGTGGTGGTGGTGG	10049.93	N/A	1.17	.17
39	Cy3- labeled-TZZGGTGGTGGTGGZZGTGGTGGTGGTGG	10169.04	N/A	1.64	.01
40	Cy3- labeled-ZZTGGTGGTGGTGGZZGTGGTGGTGGTGG	10169.04	N/A	0.8	.01
41	Cy3- labeled-ZTZGGTGGTGGTGGZZGTGGTGGTGGTGG	10169.04	N/A	1.9	∗∗
42	Cy3- labeled-ZZZGGTGGTGGTGGZZGTGGTGGTGGTGG	10288.15	10288.41	1.21	.03
43	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGZGGTTGZGGTGGTGGTGG	9930.82	N/A	0.89	.01
44	Cy3- labeled-TTTGGTGGZGGTGGTTGTGGZGGTGGTGG	9930.82	N/A	1.04	.77
45	Cy3- labeled-TTTGGZGGTGGTGGTTGTGGTGGZGGTGG	9930.82	N/A	1.17	.14
46	Cy3- labeled-TTTGGTGGZGGZGGTTGZGGZGGZGGTGG	10288.15	N/A	1.01	.94
47	Cy3- labeled-TTTGGZGGZGGZGGTTGZGGZGGTGGZGG	10407.26	N/A	1.11	.08
AS	Cy3- labeled-TTTGGTGGTGGTGGTTGTGGTGGTGGTGG	9692.6 0	9693.85	1
Mt	Cy3-labeled-TTTCCTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCTCC	9012.09	9012.7	0.26	∗∗

Cy3-(5-BzdU)-modified-AS1411 derivatives contained 5-(𝑁-benzylcarboxyamide)-2^-deoxyuridine in Z. AS indicates the original sequence of AS1411 and Mt indicates the mutant form of AS1411. ∗∗, The value of observed mass for 49 compounds was randomly measured and N/A indicates no value available.