Inference of Tumor Phylogenies from Genomic Assays on Heterogeneous Samples

Table 3

Amplified markers with probe boundaries and corresponding cytogenetic coordinates for the data of Pollack et al. [25].

Marker ID	Start probe ID	End probe ID	Cytogenetic coordinate
1	1	37	1p36
2	136	272	1p34-1p22
3	330	649	1p13-1q44
4	671	790	2p24-2p13
5	1170	1210	3p25-3p21
6	1810	1889	5p15-5q11
7	2056	2229	5q23-6p21
8	2253	2331	6p21
9	2532	2865	7p22-7q36
10	2935	3106	8p12-8q24
11	3235	3264	9q22-9q31
12	3800	3926	11q12-11q14
13	4194	4255	12q12-12q14
14	4478	4522	13q22-14q11
15	4523	4566	14q11-14q12
16	4968	5367	16p13.3-17q11
17	5384	5448	17q11.2-17q21
18	5478	6056	17q21-19q13.4
19	6057	6230	20p13-20q13.33
20	6231	6312	21q11-21q22.3