A Systematic Analysis of miRNA-mRNA Paired Variations Reveals Widespread miRNA Misregulation in Breast Cancer

Table 2

Distribution of DE-MMPVs associated with ER, TP53, and subtype status.

Feature	miRNA	mRNA	Regulatory pattern
ER	hsa-miR-375(D)	PRKX(U)	D_D_D*
	hsa-miR-375(D)	FOLR1(U)	D_U_D*
	hsa-miR-375(D)	STAP2(U)	U_U_U*
	hsa-miR-375(D)	KIAA0232(D)	U_U_U*
	hsa-miR-375(D)	TBX19(U)	U_D_D*
TP53	hsa-miR-7(D)	ALG3(D)	D_U_U*
	hsa-miR-155(D)	VCAM1(D)	D_U_U*
	hsa-miR-155(D)	ETS1(D)	D_U_U*
	hsa-miR-155(D)	CBFB(D)	D_U_U*
	hsa-miR-155(D)	ARL5B(D)	D_U_U*
	hsa-miR-145(U)	MUC1(U)	D_U_U*
	hsa-let-7b(U)	CCND1(U)	D_U_U*
	hsa-miR-375(U)	LDHB(D)	D_U_D*
	hsa-miR-7(D)	TCOF1(D)	D_D_U*
	hsa-miR-7(D)	KCNJ14(D)	D_D_U*
	hsa-miR-145(U)	FSCN1(D)	D_D_U*
	hsa-let-7b(U)	CHMP2A(U)	D_D_U*
	hsa-miR-375(U)	PRKX(D)	D_D_D*
	hsa-miR-29c(U)	LAMC1(U)	D_D_D*
	hsa-miR-29c(U)	DNMT3B(D)	D_D_D*
	hsa-miR-29c(U)	COL3A1(U)	D_D_D*
	hsa-miR-214(U)	HSPD1(D)	D_D_D*
	hsa-miR-155(D)	ARID2(U)	D_D_D*
	hsa-miR-145(U)	CCDC43(U)	D_D_D*
	hsa-miR-107(U)	CDK6(D)	D_D_D*
	hsa-let-7b(U)	SPCS3(D)	D_D_D*
Subtype	hsa-miR-155(D)	ETS1(D)	D_U_U*
	hsa-miR-155(D)	CSF1R(D)	D_U_U*
	hsa-miR-155(D)	CBFB(D)	D_U_U*
	hsa-miR-146a(D)	SAMD9L(D)	D_U_U*
	hsa-miR-146a(D)	EPSTI1(D)	D_U_U*
	hsa-miR-146a(D)	BCL2A1(D)	D_U_U*
	hsa-miR-145(U)	MUC1(U)	D_U_U*
	hsa-miR-375(U)	AKAP7(D)	D_U_D*
	hsa-miR-193b(U)	MAT2A(U)	D_D_U*
	hsa-miR-145(U)	FSCN1(D)	D_D_U*
	hsa-let-7b(U)	CHMP2A(U)	D_D_U*
	hsa-miR-29c(U)	CDK6(D)	D_D_D*