Phylogenetic Information Content of Copepoda Ribosomal DNA Repeat Units: ITS1 and ITS2 Impact

Table 2

Pairwise uncorrected genetic distance among 18 sequences of Cyclopoida based on comparison of 28S rRNA gene.

#	Species name	1	2	3	4	5	6	7	8	9	10	11	12	13	14	15	16	17
1	Oncaea sp.
2	Paracyclopina nana	0.229
3	Oithona similis	0.230	0.148
4	Oithona helgolandica	0.227	0.143	0.011
5	Oithona nana	0.233	0.181	0.155	0.146
6	Oithona simplex	0.244	0.152	0.175	0.166	0.177
7	Cyclops kolensis	0.209	0.223	0.197	0.195	0.244	0.212
8	Cyclops strenuus	0.207	0.220	0.197	0.195	0.242	0.207	0.005
9	Cyclops insignis Moscow	0.216	0.223	0.204	0.203	0.245	0.201	0.037	0.032
10	C. insignis Borok	0.209	0.216	0.198	0.197	0.241	0.197	0.027	0.023	0.014
11	Diacyclops bicuspidatus	0.186	0.200	0.183	0.180	0.224	0.194	0.090	0.085	0.098	0.087
12	Thermocyclops oithonoides	0.220	0.203	0.191	0.186	0.216	0.184	0.128	0.123	0.120	0.116	0.098
13	Thermocyclops crassus	0.218	0.203	0.181	0.178	0.220	0.204	0.127	0.125	0.127	0.125	0.093	0.084
14	Mesocyclops leuckarti	0.198	0.183	0.174	0.171	0.215	0.181	0.133	0.128	0.123	0.122	0.090	0.087	0.079
15	Macrocyclops albidus	0.221	0.198	0.197	0.191	0.215	0.178	0.145	0.143	0.137	0.134	0.099	0.131	0.114	0.105
16	Macrocyclops distinctus	0.230	0.216	0.192	0.192	0.218	0.191	0.152	0.148	0.143	0.142	0.113	0.127	0.143	0.131	0.123
17	Megacyclops viridis Borok1	0.213	0.207	0.195	0.192	0.230	0.191	0.137	0.134	0.134	0.123	0.105	0.116	0.117	0.114	0.130	0.139
18	M. viridis Borok2	0.207	0.210	0.206	0.203	0.236	0.198	0.123	0.122	0.127	0.119	0.085	0.114	0.110	0.105	0.125	0.130	0.050

All positions containing gaps and missing data were eliminated (complete deletion option). Final dataset, 657 positions.