Research Article
Identification of Virulence Factors Genes in Escherichia coli Isolates from Women with Urinary Tract Infection in Mexico
Table 3
Virulence genes and phylogenetic group.
| | # Strain | Ecp | fimH | papC | sfa/focDE | focG | sfaS | hlyA | cnf-1 | cdtB | cvaC | iutA | ibeA | Rfc | traT | fyuA | chuA | yja | TSP | PG |
| | 1 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | + | + | + | − | + | + | + | + | + | B2 | | 2 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | − | − | D | | 3 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 4 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | A | | 5 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | A | | 6 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | − | + | − | A | | 7 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 8 | + | − | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 9 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | A | | 10 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 11 | + | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | A | | 12 | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 13 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 14 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | B2 | | 15 | + | − | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 16 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | + | − | A | | 17 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | + | − | A | | 18 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 19 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 20 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | B1 | | 21 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 22 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | B2 | | 23 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | − | − | − | A | | 24 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | B2 | | 25 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | A | | 26 | − | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | − | B2 | | 27 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | − | B2 | | 28 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 29 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | D | | 30 | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 31 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | − | + | + | B1 | | 32 | + | + | + | + | − | − | + | + | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | B2 | | 33 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | B2 | | 34 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | − | A | | 35 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | + | + | B2 | | 36 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | − | − | D | | 37 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 38 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | B2 | | 39 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | + | − | − | D | | 40 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | − | B2 | | 41 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 42 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 43 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | − | − | A | | 44 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | A | | 45 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | A | | 46 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 47 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 48 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | A | | 49 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 50 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | − | A | | 51 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | B2 | | 52 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | A | | 53 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | A | | 54 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 55 | + | + | + | + | + | − | − | − | − | + | + | − | − | + | − | + | + | − | B2 | | 56 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | + | − | A | | 57 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 58 | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | B1 | | 59 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | D | | 60 | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | + | − | A | | 61 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | A | | 62 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 63 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 64 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 65 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | + | + | B2 | | 66 | + | + | + | + | + | − | + | + | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | B2 | | 67 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | + | + | B1 | | 68 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | B2 | | 69 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | − | B2 | | 70 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | − | A | | 71 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | + | − | A | | 72 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | A | | 73 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | | A | | 74 | + | + | + | + | − | + | + | + | − | − | − | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 75 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 76 | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | A | | 77 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 78 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | A | | 79 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | + | + | − | B2 | | 80 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | B2 | | 81 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 82 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | − | A | | 83 | + | + | + | + | − | + | + | + | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 84 | + | − | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | + | − | A | | 85 | + | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | A | | 86 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 87 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | + | − | A | | 88 | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | A | | 89 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | + | B1 | | 90 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | − | + | + | B1 | | 91 | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | B1 | | 92 | + | − | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | B1 | | 93 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | B1 | | 94 | + | + | + | + | − | − | − | + | − | − | + | − | − | + | + | + | + | − | B2 | | 95 | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 96 | + | + | + | + | − | − | + | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 97 | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | A | | 98 | + | + | + | + | − | − | + | + | + | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 99 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | B2 | | 100 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 101 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | + | + | + | + | B2 | | 102 | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | + | + | − | + | − | − | + | + | B1 | | 103 | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | + | + | − | B2 | | 104 | + | − | − | + | − | − | − | − | − | + | + | + | − | + | − | + | + | + | B2 | | 105 | + | + | − | + | − | − | + | − | − | − | + | − | − | + | − | + | + | + | B2 | | 106 | + | + | − | + | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | + | + | + | B2 | | 107 | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | + | − | A | | 108 | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | + | + | + | B2 |
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Phylogenetic group (PG).
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