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Research Article

A Quantitative Real-Time RT-PCR Assay for the Detection of Venezuelan equine encephalitis virus Utilizing a Universal Alphavirus Control RNA

Table 3

Relative threshold cycle (RTC) amplification efficiencies of synthetic VEEV (sVEEV) RNA constructs.


Template	sVEEV −1	sVEEV −2	sVEEV −3	sVEEV −4	sVEEV −5	sVEEV −6	sVEEV −7	sVEEV −8	sVEEV −9	sVEEV −10	sVEEV −11	sVEEV −12	sVEEV −13	sVEEV −14	sVEEV −15

Dilution	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct	Ct

10⁻⁴	17,3	20,6	19,4	19,6	17,4	21,1	18,6	17,8	18,3	18,5	20,9	19,6	20,2	24,6	21,5
10⁻⁵	21,4	24,4	23,4	23,7	21,3	25,0	22,3	21,3	21,7	22,2	24,5	23,1	24,1	28,2	25,0
10⁻⁶	25,2	28,3	27,1	27,3	25,2	28,7	26,5	25,3	25,4	25,8	28,0	27,1	27,8	31,7	28,6
10⁻⁷	28,9	31,8	30,8	31,2	29,0	32,4	30,2	28,9	28,7	29,3	31,6	30,9	31,9	35,5	32,4
10⁻⁸	31,8	34,6	34,2	34,7	32,7	36,1	33,7	32,2	32,2	32,8	35,3	34,9	35,6	39,1	36,1

Slope \|	−2,99\| 0,9969	−2,91\| 0,9959	−3,05\| 0,9992	−3,1\| 0,9995	−3,16\| 0,9998	−3,08\| 0,9998	−3,16\| 0,9992	−2,98\| 0,9993	−2,85\| 0,9999	−2,92\| 0,9999	−2,95\| 1	−3,17\| 0,9997	−3,18\| 0,9999	−2,99\| 0,9999	−3,00\| 0,9998

Mean ΔCt	0,0	−3,0	−2,1	−2,4	−0,2	−3,7	−1,4	−0,2	−0,3	−0,8	−3,2	−2,2	−3,0	−6,9	−3,8
Mean RTC	1,0	0,12	0,24	0,19	0,87	0,08	0,39	0,89	0,80	0,57	0,11	0,22	0,12	0,01	0,07

ΔCt is calculated as mean difference of corresponding Ct values compared to unmodified reference template sVEEV-1 across all template dilutions. RTC is calculated according RTC = .