Table 2: Hydrogen bond percentages ( 10%) for the simulations of double-stranded amylose in pure water and in DMSO and for methylated molecules as well as for the (alchemical) molecules with excluded hydrogen bond interactions all at 313 K. (molecule number: sugar unit number: atom name).

Solute-solute hydrogen bondPercentage hydrogen bonding
In waterIn DMSO
Donor atomAcceptor atomExcluded H-bondsMethylated structureMethylated structure

1 : 1 : 1 : 2 : 7100900
1 : 2 : 1 : 3 : 69 0 0 93 0
1 : 3 : 1 : 4 : 35 0 0 92 0
1 : 4 : 1 : 5 : 18 17 0 94 0
1 : 5 : 1 : 6 : 24 0 0 93 0
1 : 6 : 1 : 7 : 37 0 0 92 0
1 : 7 : 1 : 8 : 46 0 0 69 0
1 : 8 : 1 : 9 : 41 0 0 85 0

2 : 1 : 2 : 2 : 40 0 0 84 0
2 : 2 : 2 : 3 : 38 0 0 87 0
2 : 3 : 2 : 4 : 47 0 0 92 0
2 : 4 : 2 : 5 : 58 0 0 93 0
2 : 5 : 2 : 6 : 41 0 0 93 0
2 : 6 : 2 : 7 : 26 0 0 91 0
2 : 7 : 2 : 8 : 32 0 0 90 0
2 : 8 : 2 : 9 : 37 0 0 85 0