Research Article
Polymorphic Amplified Typing Sequences and Pulsed-Field Gel Electrophoresis Yield Comparable Results in the Strain Typing of a Diverse Set of Bovine Escherichia coli O157:H7 Isolates
Table 2
XbaI -based PATS profiles of the 25 bovine O157 isolates. AvrII-based PATS profiles of the 25 bovine O157 isolates.
(a) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(b) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
aPATS types are designated arbitrarily with different numbers. bPrefixes of each PATS primer pair A/B are indicated. 0: no amplicon; 2: amplicon with one XbaI site. cBovine E. coli O157:H7 isolates from different locations that fell within a given PATS type. dPrefixes of each PATS primer pair A/B are indicated. 0: no amplicon; 1: amplicon without AvrII site; 2: amplicon with one AvrII site. |