Research Article

A Multicenter Trial Defining a Serum Protein Signature Associated with Pancreatic Ductal Adenocarcinoma

Table 2

The top 25 differentially expressed analytes as derived from Student’s -test. The Benjamini Hochberg -value is shown for each antibody. For antigens targeted by multiple clones, the individual antibody clone suffix is shown within brackets.

Antibody-value

PDAC-NPC-OPD

GAK (3)1.21E − 45
IL-6 (7)5.86E − 41
GAK (2)3.18E − 34
IL-11 (2)1.30E − 30
LDL (2)3.57E − 30
TNF-α (3)9.22E − 30
Procathepsin W2.04E − 25
IL-13 (3)2.98E − 25
MAPK8 (1)9.85E − 21
IL-1α (1)1.71E − 18
IL-13 (2)8.94E − 18
TNFRSF3 (1)2.08E − 14
IL-18 (2)1.20E − 13
IL-1ra (1)2.02E − 13
HADH2 (3)2.07E − 13
CD40 (1)2.71E − 13
Cystatin C (4)4.07E − 13
IL-4 (3)5.08E − 13
CIMS (18)1.06E − 12
CIMS (16)1.06E − 12
VEGF (3)1.19E − 12
FASN (3)1.57E − 12
TGF-β1 (2)3.19E − 12
CIMS (26)3.19E − 12
CIMS (25)7.18E − 12

PDAC versus NPC

Upregulated in PDAC
VEGF (3)4.05E − 11
IL-1ra (1)7.90E − 11
C1 inh. (1)2.70E − 10
C1q8.05E − 10
VEGF (1)9.36E − 10
IL-16 (3)9.36E − 10
CD40L1.01E − 09
IL-4 (3)1.36E − 09
Sialyl Lewis x1.39E − 09
IL-18 (2)1.57E − 09
CIMS (18)1.90E − 09
CIMS (23)3.36E − 09
MCP-1 (2)3.76E − 09
CIMS (25)4.03E − 09

Downregulated in PDAC
GAK (3)1.01E − 27
IL-6 (7)1.62E − 25
GAK (1)3.17E − 24
LDL (2)8.45E − 21
MAPK8 (1)2.48E − 18
IL-11 (2)2.23E − 16
TNF-α (3)1.23E − 14
HADH2 (3)9.12E − 14
Procathepsin W1.05E − 12
TNFRSF3 (1)1.49E − 11
IL-13 (3)5.72E − 10

PDAC versus OPD

Upregulated in PDAC
Cystatin C (3)1.11E − 08
IL-13 (3)1.59E − 08
IL-1α (1)3.01E − 08
Surface ag X2.84E − 07
BTK (2)2.84E − 07
Cystatin C (4)2.84E − 07
CIMS (26)2.84E − 07
CD40 (1)3.75E − 07
TNFRSF3 (2)4.19E − 07
ORP-3 (2)6.34E − 07
Apo-A4 (3)6.93E − 07
UPF3B (2)6.93E − 07
MUC-1 (1)7.87E − 07
TNF-α (3)9.02E − 07
CIMS (16)9.12E − 07
ATP-5B (1)1.03E − 06
CIMS (12)1.03E − 06
IL-13 (1)1.03E − 06
MCP-1 (4)1.49E − 06
CIMS (1)1.67E − 06
CD40 (3)1.79E − 06
Procathepsin W1.90E − 06
TGF-β1 (2)2.29E − 06
CIMS (24)3.89E − 06
IL-18 (2)5.59E − 06