Methodology Report
Identification of Multiple Hypoxia Signatures in Neuroblastoma Cell Lines by - Regularization and Data Reduction
Table 3
Hypoxia signatures generated after data filtering.
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
(1)Probeset ID according to Affymetrix HG-U133 Plus 2.0 GeneChip. (2)GenBank mRNA accession number. (3)Frequency score as calculated by regularization for the selected probesets in the hypoxia signatures compared to the All-Chip signature. Apo: apoptosis; Gly: glycolisis; OxP: oxidative phosphorylation; All: All-chip. |