Research Article

Estimating Network Kinetics of the MAPK/ERK Pathway Using Biochemical Data

Table 11

Posterior means ( ), standard deviations ( ), and acceptance ratios ( ) for the estimated rate constants for Model 4 from the western blotting data when and are time units, respectively. The estimates are based on 15,000 MCMC runs after 85,000 burn-in runs.

Reaction unit unit
μσ μσ

0.035 0.082
0.035 0.082
0.035 0.082
0.131 0.101
0.131 0.101
0.131 0.101
0.109 0.166
0.109 0.166
0.109 0.166
0.129 0.096
0.129 0.096
0.129 0.096
0.048 0.081
0.048 0.081
0.048 0.081
0.066 0.106
0.067 0.106
0.066 0.106
0.123 0.099
0.122 0.098
0.122 0.099
0.015 0.070
0.015 0.071
0.015 0.071
0.030 0.064
0.030 0.064
0.030 0.064
0.077 0.083
0.077 0.083
0.076 0.082
0.081 0.058
0.081 0.058
0.081 0.058
0.042 0.093
0.042 0.093
0.042 0.093
0.134 0.064
0.133 0.064
0.133 0.064
0.005 0.083
0.005 0.083
0.005 0.083
0.012 0.051
0.012 0.051
0.012 0.051
0.011 0.066
0.011 0.065
0.011 0.066