The Scientific World Journal

Research Article

Genetic Diversity of Arabica Coffee (Coffea arabica L.) in Nicaragua as Estimated by Simple Sequence Repeat Markers

Table 5

The Nei’s standard genetic distance (above the diagonal) and the pairwise (below the diagonal) between the 26 pairs of arabica coffee populations.


	B1	B2	B3	B4	B5	CA1	CA2	CA3	CA4	CA5	CM1	CM2	CM3	CM4	CR1	CR2	CR3	CT1	CT2	CT3	CT4	CT5	CT6	M	P	PA

B1		0.065	0.006	0.005	0.005	0.013	0.013	0.014	0.001	0.001	0.010	0.376	0.255	0.093	0.001	0.006	0.000	0.002	0.018	0.006	0.012	0.008	0.002	0.006	0.015	0.004
B2	+		0.073	0.069	0.056	0.074	0.074	0.076	0.064	0.063	0.060	0.156	0.077	0.014	0.067	0.072	0.065	0.058	0.017	0.070	0.077	0.051	0.066	0.070	0.042	0.064
B3	−	+		0.002	0.003	0.004	0.005	0.005	0.004	0.007	0.010	0.392	0.275	0.112	0.009	0.023	0.004	0.004	0.023	0.002	0.004	0.006	0.003	0.006	0.030	0.004
B4	−	+	−		0.001	0.002	0.002	0.003	0.002	0.006	0.008	0.379	0.267	0.110	0.008	0.023	0.003	0.002	0.021	0.000	0.002	0.004	0.001	0.005	0.030	0.003
B5	−	+	−	−		0.003	0.003	0.004	0.002	0.005	0.008	0.350	0.242	0.092	0.008	0.021	0.003	0.001	0.014	0.001	0.003	0.003	0.001	0.005	0.024	0.003
CA1	+	+	−	−	−		0.000	0.000	0.007	0.013	0.011	0.373	0.272	0.124	0.017	0.037	0.010	0.007	0.026	0.002	0.001	0.006	0.004	0.009	0.043	0.007
CA2	−	+	−	−	−	−		0.000	0.006	0.013	0.011	0.373	0.272	0.124	0.017	0.036	0.009	0.006	0.026	0.001	0.001	0.006	0.004	0.009	0.042	0.006
CA3	+	+	+	−	−	−	−		0.008	0.015	0.012	0.375	0.275	0.127	0.019	0.040	0.011	0.008	0.028	0.002	0.001	0.006	0.005	0.010	0.045	0.007
CA4	−	+	−	−	−	+	−	+		0.001	0.007	0.364	0.252	0.098	0.003	0.012	0.001	0.000	0.017	0.003	0.007	0.004	0.000	0.005	0.020	0.003
CA5	−	+	−	−	−	−	−	−	−		0.008	0.360	0.246	0.091	0.001	0.007	0.001	0.002	0.017	0.007	0.013	0.007	0.003	0.005	0.013	0.004
CM1	−	+	−	−	−	−	−	+	+	−		0.297	0.209	0.100	0.011	0.024	0.009	0.008	0.019	0.008	0.011	0.002	0.007	0.006	0.026	0.003
CM2	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		0.023	0.191	0.379	0.379	0.376	0.353	0.248	0.378	0.389	0.306	0.369	0.369	0.311	0.345
CM3	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		0.092	0.255	0.250	0.257	0.243	0.147	0.267	0.280	0.213	0.257	0.259	0.196	0.240
CM4	+	−	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+		0.090	0.085	0.096	0.091	0.036	0.112	0.124	0.089	0.103	0.101	0.044	0.100
CR1	−	+	−	−	−	+	−	+	−	−	−	+	+	+		0.004	0.001	0.003	0.019	0.009	0.016	0.010	0.005	0.006	0.012	0.005
CR2	−	+	+	+	+	+	+	+	+	−	+	+	+	+	−		0.009	0.013	0.026	0.025	0.037	0.024	0.016	0.020	0.011	0.018
CR3	−	+	−	−	−	+	−	+	−	−	−	+	+	+	−	+		0.001	0.018	0.004	0.009	0.006	0.001	0.005	0.018	0.003
CT1	−	+	−	−	−	−	−	−	−	−	−	+	+	+	−	+	−		0.015	0.003	0.007	0.004	0.001	0.005	0.019	0.003
CT2	+	−	+	+	−	+	+	+	+	−	−	+	+	+	+	+	+	−		0.021	0.027	0.013	0.018	0.020	0.014	0.018
CT3	+	+	−	−	−	−	−	−	−	−	−	+	+	+	−	+	−	−	+		0.001	0.003	0.001	0.005	0.032	0.003
CT4	+	+	−	−	−	−	−	−	+	−	−	+	+	+	+	+	−	−	+	−		0.006	0.004	0.007	0.042	0.006
CT5	−	+	−	−	−	−	−	+	+	−	−	+	+	+	+	+	−	−	−	−	−		0.004	0.004	0.023	0.002
CT6	+	+	−	−	−	+	−	+	+	−	−	+	+	+	+	+	+	−	+	−	+	−		0.004	0.024	0.002
M	−	+	−	−	−	+	−	+	+	−	−	+	+	+	−	+	−	−	+	−	−	−	+		0.020	0.002
P	−	+	+	+	+	+	+	+	+	−	+	+	+	+	−	−	+	+	−	+	+	+	+	+		0.022
PA	−	+	−	−	−	−	−	−	−	−	−	+	+	+	−	+	−	−	−	−	−	−	−	−	+

+: Significant differentiation between the pair of populations ().
−: No significant differentiation between the pair of populations ().