Research Article
A Novel Method for Functional Annotation Prediction Based on Combination of Classification Methods
Table 6
Error rate for each GO term.
| GO | Error rate using SVM with feature selection | Error rate using SMO with feature selection | Error rate using weighted IPR SVM with feature selection | Error rate using weighted IPR SMO with feature selection |
| GO:0000324 | 0.030303 | 0.045455 | 0.030303 | 0.166667 | GO:0000329 | 0.090909 | 0.136364 | 0.075758 | 0.257576 | GO:0000398 | 0.025641 | 0.025641 | 0.025641 | 0.128205 | GO:0003677 | 0.055556 | 0.055556 | 0.051852 | 0.096296 | GO:0003700 | 0.033333 | 0.033333 | 0.033333 | 0.055556 | GO:0003723 | 0.026316 | 0.026316 | 0.035088 | 0.096491 | GO:0003735 | 0.033333 | 0.038889 | 0.053333 | 0.06 | GO:0005515 | 0.128571 | 0.142857 | 0.144444 | 0.266667 | GO:0005524 | 0.166667 | 0.177778 | 0.144444 | 0.266667 | GO:0005730 | 0.116667 | 0.116667 | 0.108333 | 0.166667 | GO:0005732 | 0.060606 | 0.060606 | 0.060606 | 0.106061 | GO:0005743 | 0.208333 | 0.263889 | 0.208333 | 0.416667 | GO:0005783 | 0.22069 | 0.234483 | 0.224138 | 0.275862 | GO:0005789 | 0.075758 | 0.075758 | 0.106061 | 0.242424 | GO:0005829 | 0.090909 | 0.090909 | 0.1 | 0.254545 | GO:0005886 | 0.123077 | 0.123077 | 0.115385 | 0.182692 | GO:0005935 | 0.111111 | 0.111111 | 0.041667 | 0.152778 | GO:0006281 | 0.151515 | 0.181818 | 0.151515 | 0.227273 | GO:0006355 | 0.133333 | 0.15 | 0.133333 | 0.166667 | GO:0006365 | 0.075758 | 0.090909 | 0.075758 | 0.166667 | GO:0006412 | 0.05303 | 0.05303 | 0.056818 | 0.079545 | GO:0006457 | 0.030303 | 0.030303 | 0.045455 | 0.166667 | GO:0006468 | 0.009804 | 0.039216 | 0.009804 | 0.058824 | GO:0006511 | 0.030303 | 0.030303 | 0.030303 | 0.121212 | GO:0006888 | 0 | 0 | 0 | 0.083333 | GO:0006897 | 0.013889 | 0.013889 | 0.013889 | 0.152778 | GO:0006950 | 0.090909 | 0.106061 | 0.060606 | 0.212121 | GO:0007047 | 0.083333 | 0.125 | 0.092593 | 0.148148 | GO:0009060 | 0.066667 | 0.066667 | 0.066667 | 0.316667 | GO:0009277 | 0 | 0 | 0 | 0.016667 | GO:0016020 | 0.05 | 0.05 | 0.05 | 0.166667 | GO:0016021 | 0.029412 | 0.029412 | 0.019608 | 0.078431 |
|
|