International Journal of Carbohydrate Chemistry

Research Article

On the Conformational Properties of Amylose and Cellulose Oligomers in Solution

Table 2

Hydrogen bond percentages (10%) for the simulations of double-stranded amylose in pure water and in DMSO and for methylated molecules as well as for the (alchemical) molecules with excluded hydrogen bond interactions all at 313 K. (molecule number: sugar unit number: atom name).


Solute-solute hydrogen bond				Percentage hydrogen bonding
		In water			In DMSO
Donor atom	Acceptor atom		Excluded H-bonds	Methylated structure		Methylated structure

1 : 1 :	1 : 2 :	71	0	0	90	0
1 : 2 :	1 : 3 :	69	0	0	93	0
1 : 3 :	1 : 4 :	35	0	0	92	0
1 : 4 :	1 : 5 :	18	17	0	94	0
1 : 5 :	1 : 6 :	24	0	0	93	0
1 : 6 :	1 : 7 :	37	0	0	92	0
1 : 7 :	1 : 8 :	46	0	0	69	0
1 : 8 :	1 : 9 :	41	0	0	85	0

2 : 1 :	2 : 2 :	40	0	0	84	0
2 : 2 :	2 : 3 :	38	0	0	87	0
2 : 3 :	2 : 4 :	47	0	0	92	0
2 : 4 :	2 : 5 :	58	0	0	93	0
2 : 5 :	2 : 6 :	41	0	0	93	0
2 : 6 :	2 : 7 :	26	0	0	91	0
2 : 7 :	2 : 8 :	32	0	0	90	0
2 : 8 :	2 : 9 :	37	0	0	85	0