Molecular Screening of Virulence Genes in Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli Isolated from Human Blood Culture in Brazil
Table 3
Study of pathogenicity islands, phylogenetic classification, and virulence genes in 20 ExPEC strains from human hemocultures.
Strains
PC
Pathogenicity islands
Virulence genes
IV536
ICFT073
IICFT073
IJ96
kpsII
K1
fyuA
papC
papG
sfaA
Ibe10
hly
cnf1
cnf2
traT
iutA
iroN
ompT
hlyF
iss
1
B2
+
+
+
−
+
−
−
+
+
+
−
+
−
−
−
+
+
−
−
−
2
B2
+
+
+
−
+
+
−
−
−
−
−
−
−
−
−
+
+
−
−
−
3
B2
+
+
−
−
+
+
−
−
−
−
−
−
−
−
−
+
−
−
−
−
4
B2
−
−
−
+
+
+
−
−
−
−
+
−
−
−
−
+
−
−
−
−
5
A
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
+
−
+
+
+
+
6
A
−
−
−
−
−
−
−
+
+
−
−
−
−
−
+
+
+
−
−
−
7
B2
+
+
−
−
+
−
+
+
+
−
−
+
−
−
+
+
+
−
−
−
8
B2
+
+
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
9
B2
+
+
−
−
+
+
+
+
+
+
−
+
−
−
−
+
−
−
−
−
10
B1
+
−
−
−
−
−
+
−
−
−
−
+
−
+
+
−
+
+
+
+
11
A
+
−
−
−
−
−
+
−
−
−
−
+
−
−
+
+
+
−
−
−
12
B1
+
−
−
−
−
−
+
−
−
−
+
−
−
−
−
−
−
−
−
−
13
A
−
−
−
−
+
+
+
+
+
−
−
+
−
−
+
+
−
−
−
−
14
A
−
−
−
−
+
+
−
+
+
−
−
−
−
−
+
+
+
−
−
−
15
A
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
+
−
−
−
−
16
B2
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
+
−
−
−
17
D
+
−
−
−
−
−
+
−
−
−
−
−
−
−
+
+
−
−
−
−
18
B1
+
−
−
−
−
−
+
−
−
−
−
−
−
−
+
−
−
−
−
−
19
D
+
−
−
−
−
−
+
−
−
−
−
−
−
−
+
+
+
−
−
+
20
B1
−
−
+
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
−
+
+
−
+
PC: phylogenetic classification; pathogenicity islands: PAI IV536, PAI ICFT073, PAI IICFT073, and PAI IJ96; adhesions: papC, papG, sfaA, sfaS, and afa; invasion: ibe10; toxins: cnf2, cnf1, hlyA, hlyF, and cvaC; iron uptake systems: fyuA, iutA, and iroN; serum resistance: kps II, K1, traT, and iss; proteases: ompT.