A Two-Tube Multiplex Reverse Transcription PCR Assay for Simultaneous Detection of Viral and Bacterial Pathogens of Infectious Diarrhea
Table 2
Bacterial test panel for the evaluation of specificity of PCR primers.
Isolates
Number of the isolatesd
Targeted gene loci of bacteria
ipaH
tlh
eaeA
invA
ail
ctxA
mapA
Salmonella enteritidis
CMCCa 50041
−
−
−
+
−
−
−
Shigella flexneri
CMCC 51537
+
−
−
−
−
−
−
Shigella sonnei
2
+
−
−
−
−
−
−
EIEC
1
+
−
−
−
−
−
−
EHEC
3
−
−
+
−
−
−
−
EPEC
2
−
−
+
−
−
−
−
Vibrio parahaemolyticus
CICCb 21617
−
+
−
−
−
−
−
Vibrio cholera O1
2
−
−
−
−
−
+
−
Vibrio cholera O139
1
−
−
−
−
−
+
−
Yersinia enterocolitica
3
−
−
−
−
+
−
−
Campylobacter. jejuni
4
−
−
−
−
−
−
+
Vibrio mimicus
CICC 21613
−
−
−
−
−
−
−
Vibrio fluvialis
3
−
−
−
−
−
−
−
Staphylococcus aureus
ATCCc 29213
−
−
−
−
−
−
−
Listeria monocytogenes
CMCC 54004
−
−
−
−
−
−
−
CMCC: National Center for Medical Culture Collection; bCICC: China Center of Industrial Culture Collection; cATCC: American Type Culture Collection; dthe isolates in this panel consisted of clinical isolates and preserved standard strain.