Identifying Liver Cancer-Related Enhancer SNPs by Integrating GWAS and Histone Modification ChIP-seq Data

Table 1

Summary of liver cancer-associated SNPs from GRASP database.

SNP ID	value	Chromosome	Populations	PMID
rs17401966	1.20E − 19	1	CHB	20676096
rs1249458	8.30E − 06	2	CHB	22807686
rs1714259	1.10E − 06	2	CHB	22807686
rs2396470	5.10E − 07	2	CHB	20676096
rs7424161	8.80E − 06	2	CHB	22807686
rs7574865	1.70E − 11	2	CHB	23242368
rs3905886	3.70E − 06	3	CHB	22807686
rs1073547	6.80E − 06	4	CHB	22807686
rs17081345	3.70E − 07	6	CHB	20676096
rs9272105	3.30E − 23	6	CHB	22807686
rs9275319	8.70E − 19	6	CHB	23242368
rs9494257	1.10E − 14	6	CHB	20676096
rs12682266	6.70E − 06	8	CHB	22174901
rs1573266	7.40E − 06	8	CHB	22174901
rs2275959	6.40E − 06	8	CHB	22174901
rs7821974	7.00E − 06	8	CHB	22174901
rs7898005	7.00E − 08	10	CHB	20676096
rs10160758	6.00E − 06	11	CHB	22807686
rs10896464	6.50E − 06	11	CHB	22807686
rs2611145	9.30E − 06	11	CHB	22174901
rs3825023	3.10E − 06	11	CHB	22807686
rs7119426	3.50E − 06	11	CHB	22807686
rs402071	8.60E − 06	19	CHB	22807686
rs3092194	4.40E − 06	20	CHB	22807686
rs368007	9.90E − 06	20	CHB	22807686
rs455804	4.40E − 10	21	CHB	22807686
rs1980215	2.30E − 06	3	JPT	21499248
rs2596542	4.20E − 13	6	JPT	21499248
rs9275572	1.40E − 09	6	JPT	21499248
rs1568658	6.90E − 06	7	JPT	21499248
rs952656	2.80E − 06	8	JPT	21499248
rs4363614	4.20E − 07	11	JPT	21499248
rs1957496	4.60E − 06	14	JPT	21499248
rs8019534	3.90E − 06	14	JPT	21499248
rs1794304	3.60E − 06	16	JPT	21725309
rs2208456	3.80E − 06	20	JPT	21499248
rs1012068	1.30E − 14	22	JPT	21725309
rs11703779	4.20E − 06	22	JPT	21725309
rs4820994	3.00E − 06	22	JPT	21725309
rs4820996	4.20E − 06	22	JPT	21725309
rs5753816	4.90E − 06	22	JPT	21725309
rs5753818	9.40E − 06	22	JPT	21725309
rs5998152	1.20E − 07	22	JPT	21725309
rs7287054	3.80E − 06	22	JPT	21725309
rs737084	5.90E − 06	22	JPT	21725309