Research Article
SAMA: A Fast Self-Adaptive Memetic Algorithm for Detecting SNP-SNP Interactions Associated with Disease
Table 1
Details of three two-locus disease models.
| MAF | | 0.05 | | | | 0.10 | | | | 0.20 | | | | 0.50 | | AA | Aa | aa | | AA | Aa | aa | | AA | Aa | aa | | AA | Aa | aa |
| Model 1 (, ) | BB | 0.098 | 0.098 | 0.098 | BB | 0.096 | 0.096 | 0.096 | BB | 0.092 | 0.092 | 0.092 | BB | 0.078 | 0.078 | 0.078 | Bb | 0.098 | 0.299 | 0.522 | Bb | 0.096 | 0.197 | 0.282 | Bb | 0.092 | 0.145 | 0.181 | Bb | 0.078 | 0.105 | 0.122 | bb | 0.098 | 0.522 | 0.912 | Bb | 0.096 | 0.282 | 0.408 | Bb | 0.092 | 0.181 | 0.227 | Bb | 0.078 | 0.122 | 0.142 | Model 2 (, ) | BB | 0.096 | 0.096 | 0.096 | BB | 0.092 | 0.092 | 0.092 | BB | 0.084 | 0.084 | 0.084 | BB | 0.052 | 0.052 | 0.052 | Bb | 0.096 | 0.533 | 0.533 | Bb | 0.092 | 0.319 | 0.319 | Bb | 0.084 | 0.210 | 0.210 | Bb | 0.052 | 0.138 | 0.138 | bb | 0.096 | 0.533 | 0.533 | Bb | 0.092 | 0.319 | 0.319 | Bb | 0.084 | 0.210 | 0.210 | Bb | 0.052 | 0.138 | 0.138 | Model 3 (, ) | BB | 0.080 | 0.192 | 0.192 | BB | 0.072 | 0.164 | 0.164 | BB | 0.061 | 0.146 | 0.146 | BB | 0.067 | 0.155 | 0.155 | Bb | 0.192 | 0.080 | 0.080 | Bb | 0.164 | 0.072 | 0.072 | Bb | 0.146 | 0.061 | 0.061 | Bb | 0.155 | 0.067 | 0.067 | bb | 0.192 | 0.080 | 0.080 | Bb | 0.164 | 0.072 | 0.072 | Bb | 0.146 | 0.061 | 0.061 | Bb | 0.155 | 0.067 | 0.067 |
|
|