Selection and Evaluation of Potential Reference Genes for Quantitative Real-Time PCR in Agaricus blazei Based on Transcriptome Sequencing Data

Table 3

Ranking of candidate reference genes yielded from NormFinder programs.

Rank	5 stage		Fruit body		Stipe		Pileus		Total
	Gene	Stability	Gene	Stability	Gene	Stability	Gene	Stability	Gene	Stability
1	α-TUB	0.044	α-TUB	0.049	ATP7	0.048	Uqcrc	0.075	ATP3	0.076
2	Cox5a	0.062	Cox5a	0.067	NdufS7	0.052	ATP7	0.083	α-TUB	0.078
3	Vps26	0.068	Vps26	0.074	Uqcr8	0.070	Copb1	0.088	Cox5a	0.082
4	ATP3	0.069	ATP3	0.078	Copb1	0.073	FKS1	0.088	ATP7	0.086
5	Uqcrc	0.080	ATP7	0.079	FKS1	0.076	NDUFB9	0.098	Vps26	0.087
6	ATP2	0.080	ATP2	0.088	Vps26	0.083	Uqcr8	0.099	ATP2	0.087
7	ATP7	0.081	NdufS7	0.089	α-TUB	0.084	ATP3	0.100	FKS1	0.089
8	NdufS7	0.083	Uqcrc	0.089	ATP3	0.093	ATP2	0.100	ATP1	0.089
9	ATP1	0.088	Copb1	0.094	RPT6	0.094	RPT6	0.109	RPT6	0.091
10	RPT6	0.091	RPT6	0.097	Cdc4	0.099	Cox5a	0.110	Uqcrc	0.092
11	PUP3	0.092	ATP1	0.099	Ras	0.101	PUP3	0.119	Copb1	0.097
12	CS	0.093	Uqcr8	0.102	Uqcrc	0.103	ATP1	0.120	NdufS7	0.097
13	Cdc4	0.094	CS	0.102	NDUFB9	0.110	NdufA2	0.123	Cdc4	0.097
14	FKS1	0.097	PUP3	0.103	PUP3	0.110	ATPDH	0.134	NDUFB9	0.103
15	Copb1	0.099	Cdc4	0.104	Cox5a	0.113	α-TUB	0.140	PUP3	0.105
16	Uqcr8	0.102	NDUFB9	0.106	ATP1	0.114	Cdc4	0.143	Uqcr8	0.111
17	NDUFB9	0.104	FKS1	0.109	CS	0.121	CPR1	0.145	CS	0.112
18	ATPDH	0.117	ATPDH	0.131	ATPDH	0.123	Vps26	0.149	ATPDH	0.117
19	Gnb2	0.131	Gnb2	0.148	CPR1	0.127	CS	0.157	CPR1	0.121
20	CPR1	0.139	CPR1	0.156	SPRYp	0.134	PsmB6	0.168	Gnb2	0.133
21	SPRYp	0.158	SPRYp	0.174	PsmB6	0.140	Ras	0.173	PsmB6	0.150
22	PsmB6	0.162	PsmB6	0.182	ATP2	0.142	NdufS7	0.173	Ras	0.151
23	β-TUB2	0.175	β-TUB2	0.196	Gnb2	0.148	Gnb2	0.212	SPRYp	0.167
24	Ras	0.188	Ras	0.211	GAPDH	0.213	β-TUB2	0.225	β-TUB2	0.187
25	NdufA2	0.223	NdufA2	0.212	β-TUB2	0.300	SPRYp	0.235	NdufA2	0.194
26	GAPDH	0.260	GAPDH	0.282	NdufA2	0.321	GAPDH	0.329	GAPDH	0.229