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Genes | Primers (forward and reverse) | Products (bp) |
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PTCH | 5′-TGGAACGAGGACAAAGCGG-3′ | 202 |
5′-AGGCATAGGCGAGCATGAGTAA-3′ |
SMO | 5′-TCTCGGGCAAGACCTCCTACT-3′ | 146 |
5′-CGCACGGTATCGGTAGTTCTT-3′ |
GLI1 | 5′-CCAAGCACCAGAATCGGACC-3′ | 140 |
5′-TTTGGTCACATGGGCGTCAG-3′ |
GLI2 | 5′-AGGGATGACTGTAAGCAGGAGG-3′ | 152 |
5′-CGGCACACAAACTCCTTCTTCT-3′ |
GLI3 | 5′-GCACTAAGCGTTACACAGACCCA-3′ | 257 |
5′-CTTCTCTGCCTTGACGGTTTTC-3′ |
SHH | 5′-CTGCTGGTATGCTCGGGACT-3′ | 106 |
5′-CATTGGGGATAAACTGCTTGTAG-3′ |
DHH | 5′-GATGACCGAGCGTTGTAAGGA-3′ | 277 |
5′-GTTATCAGCTTTGACCGACACG |
FU | 5′-TTGCTGCCCAGTTGGTGTCA-3′ | 225 |
5′-TGTGGTCGTATGGTCGCTCCT-3′ |
GAS1 | 5′-ATCTGCGAGTCGGTCAAGGA-3′ | 133 |
5′-TGCGCTGCTCGTCATCGTA-3′ |
Cdon | 5′-CTTTTCCAGCCGTCCAATAACT-3′ | 205 |
5′-GTGCCACTGCTTTGAACCTTCT-3′ |
BOC | 5′-CATCACTGCCCTTAACAACCAC-3′ | 158 |
5′-TGTTTCCCTCATCCACTTCAATC-3′ |
HH | 5′-TCACCGTCTGGCACCCTAGT-3′ | 120 |
5′-CATGGCTCCTCTTGAACCCTG-3′ |
HHIP | 5′-GAGAAGGTGCCTGAATGGGAAC-3′ | 270 |
5′-GGTGAGTGGAACAGGCTTTGA-3′ |
SUFU | 5′-GCCTTCGCTTCGCTCTTTC-3′ | 212 |
5′-AGGCCGAAGCTGATGTAGTGC-3′ |
MST1 | 5′-CGGGTCCCAGTAGCCAAGAT-3′ | 191 |
5′-GTGTCATTACCCGTACCTTTGG-3′ |
MST2 | 5′-ACCATCTGCCTTAGGAACGGA-3′ | 223 |
5′-TAATTGCGACAACTTGACCGG-3′ |
LATS1 | 5′-CCTATTAATGCCAGCATGAAACC-3′ | 220 |
5′-CGTTGCTAGGGTGAGCTTGA-3′ |
LATS | 5′-GAGCAGATTGTGCGGGTCATT-3′ | 116 |
5′-TGGTGGTAGGACGCAAACGA-3′ |
SAV1 | 5′-GAATGCCACAGAATCAGGGGA-3′ | 291 |
5′-GATGCCTGTATTGGGCCTTCTT-3′ |
MOB1A | 5′-AGTGGGAATCTGAGACAAGCTG-3′ | 224 |
5′-GGTGCAGAACATTTGATTGGCT-3′ |
MOB1B | 5′-TGGGCAGATGGAACGAACA-3′ | 232 |
5′-GAAGCTGGATCACAGGGTCAA-3′ |
YAP | 5′-GAGTTAGCCCTGCGTAGCCA-3′ | 272 |
5′-GGCAGGGTGCTTTGGTTGATA-3′ |
TAZ | 5′-CCTGAAACTCCGCCACATCT-3′ | 235 |
5′-CTGGTAGACGCCATCTCCTTTC-3′ |
Notch1 | 5′-GTCAACGCCGTAGATGACC-3′ | 101 |
5′-TTGTTAGCCCCGTTCTTCAG-3′ |
Notch2 | 5′-ACTGTGAGGAGCAACTCGAT-3′ | 133 |
5′-TCCACTTCATACTCACAGTTGA-3′ |
Notch3 | 5′-TGACCGTACTGGCGAGACT-3′ | 67 |
5′-CCGCTTGGCTGCATCAGCA-3′ |
Notch4 | 5′-AACTCCTCCCCAGGAATCTG-3′ | 168 |
5′-CCTCCATCCAGCAGAGGTT-3′ |
JAG1 | 5′-GCCAGGAAGTTTCAGGGAGA-3′ | 264 |
5′-GCTGGAGACTGGAAGACCGA-3′ |
JAG2 | 5′-CTGACTGCCGCATCAACATC-3′ | 92 |
5′-GCTACAGCGATACCCGTTGA-3′ |
DLL1 | 5′-TCTCCTGATGACCTCGCAACA-3′ | 149 |
5′-TCACACACGAAGCGGTAGGAG-3′ |
DLL3 | 5′-CACTCAACAACCTAAGGACGCA-3′ | 212 |
5′-CGAGGAAGGGTAGGGAAAAAG-3′ |
DLL4 | 5′-GACCTCTCCACAGACACCTTTG-3′ | 299 |
5′-TCCACTTCCAGCTCCTTCTTCT-3′ |
HES1 | 5′-ATTCTGGAAATGACAGTGAAGCAC-3′ | 168 |
5′-CACCTCGGTATTAACGCCCTC-3′ |
HES5 | 5′-GAAAAACCGACTGCGGAAGC-3′ | 184 |
5′-GACGAAGGCTTTGCTGTGCT-3′ |
NGN | 5′-CAGATTTGGTCCCATTTGTGAG-3′ | 279 |
5′-ATGGCAACACTACATCCTGACC-3′ |
Hey1 | 5′-GAAGCAGGTAATGGAGCAAGGA-3′ | 258 |
5′-GAAGCGTAGTTGTTGAGATGCG-3′ |
HEY2 | 5′-AAGGCTACTTTGACGCACACG-3′ | 146 |
5′-GAGATGAGACACAAGCCGCAC-3′ |
HES1 | 5′-ATTCTGGAAATGACAGTGAAGCAC-3′ | 168 |
5′-CACCTCGGTATTAACGCCCTC-3′ |
DV1 | 5′-AGAAGTCAGCTCTTGCCTCAGTT-3′ | 256 |
5′-ATCTCATCAGTAGCACGACGAAG-3′ |
AXIN | 5′-TCTGGATACCTGCCGACCTTA-3′ | 271 |
5′-TCTGCTGCTCGCTGTCGTT-3′ |
APC | 5′-CAAAACTGGAAACTGAGGCATCT-3′ | 225 |
5′-ACTCTCCAGAACGGCTTGATACA-3′ |
β-catenin | 5′-GCCAAGTGGGTGGTATAGAGG-3′ | 192 |
5′-GGGATGGTGGGTGTAAGAGC-3′ |
GSK3B | 5′-GTTAGCAGAGACAAGGACGGCA-3′ | 183 |
5′-GCAATACTTTCTTGATGGCGAC-3′ |
GBP | 5′-AGGTGGCTCCTGACGCTAA-3′ | 180 |
5′-CAGGCTGGAAGGGAAAGACA-3′ |
TCF | 5′-GAGTATGCCTACCTCAAAGCCA-3′ | 80 |
5′-AGCCGCTTGATCTTCCCTG-3′ |
FRZB | 5′-ACGGAAACTGTAGAGGGGCA-3′ | 204 |
5′-CAGTGTCCCGTGGAATGTTTAC-3′ |
c-Myc | 5′-TGCTGCCAAGAGGGTCAAGT-3′ | 160 |
5′-GCTCCGTTTTAGCTCGTTCC-3′ |
PKC | 5′-GCTTATGCTGTCATGTCCCGG-3′ | 120 |
5′-GATGATGAGGACTCCCCCCA-3′ |
RHOA | 5′-ATTGTTGGTGATGGAGCCTGTG-3′ | 83 |
5′-GTGGGCACATACACCTCTGG-3′ |
ILK | 5′-GCAGTGAATGAACACGGGAAT-3′ | 78 |
5′-CACCAGGTCCTCTGCCACTT-3′ |
CD24 | 5′-GCTCCTACCCACGCAGATTT-3′ | 109 |
5′-GGTGGCATTAGTTGGATTTGG-3′ |
CD13 | 5′-CCGACATTGACAAGACTGAGCT-3′ | 175 |
5′-ACCTTTCTGACATTGCCCTCC-3′ |
CD44 | 5′-TCCAACACCTCCCAGTATGACA-3′ | 151 |
5′-CTTTCTGGACATAGCGGGTG-3′ |
CD90 | 5′-CGCTCTCCTGCTAACAGTCTTG-3′ | 213 |
5′-GTTCGGGAGCGGTATGTGTG-3′ |
CD45 | 5′-TGAGGAGCAAGGAAGCCAATC-3′ | 77 |
5′-GCCACCAACTGAAGGCTGAAC-3′ |
ALDH1 | 5′-TGCCGACTTGGACAATGCT-3′ | 277 |
5′-GCCTCCTCCACATTCCAGTTT-3′ |
ICAM1 | 5′-CCGTTGCCTAAAAAGGAGTTGC-3′ | 221 |
5′-TGGCAGCGTAGGGTAAGGTTC-3′ |
LGR5 | 5′-CGGGAAACGCTCTGACATACAT-3′ | 260 |
5′-ACTTCTAAAAGCCTGGACGGG-3′ |
CK7 | 5′-TGAAGAAGGATGTGGATGCTGC-3′ | 119 |
5′-CAGCTCTGTCAACTCCGTCTCAT-3′ |
CK19 | 5′-AGAATTGAACCGGGAGGTCG-3′ | 257 |
5′-CCTGATTCTGCCGCTCACTA-3′ |
CD34 | 5′-GCAACATCTCCCACTAAACCCTA-3′ | 156 |
5′-GTCCTTCTTAAACTCCGCACAGC-3′ |
CD47 | 5′-ACCTCCTTCGTCATTGCCATATT-3′ | 89 |
5′-ATACACGCCGCAATACAGAGAC-3′ |
DLK1 | 5′-CCCTTTGTGACCAGTGCGTG-3′ | 183 |
5′-ATTCATAGAGGCCATCGTCCAG-3′ |
EpCAM | 5′-TAATCGTCAATGCCAGTGTACTTC-3′ | 101 |
5′-AGCCATTCATTTCTGCCTTCAT-3′ |
CD133 | 5′-TGGCATCTTCTATGGTTTTGTGG-3′ | 159 |
5′-TCCTTGGTAGTGTTGTACTGGGC-3′ |
OCT4 | 5′-GAGTGAGAGGCAACCTGGAGAAT-3′ | 292 |
5′-ACCGAGGAGTACAGTGCAGTGAA-3′ |
SOX2 | 5′-GGTTACCTCTTCCTCCCACTCC-3′ | 140 |
5′-CGCTCTGGTAGTGCTGGGAC-3′ |
NANOG | 5′-GAGAAGAGTGTCGCAAAAAAGGA-3′ | 163 |
5′-TGAGGTTCAGGATGTTGGAGAGT-3′ |
FOXD3 | 5′-GCAACTACTGGACCCTGGAC-3′ | 142 |
5′-TAAGCGCCGAAGCTCTGCAT-3′ |
SALL4 | 5′-CATCAACTCGGAGGAGGACCA-3′ | 275 |
5′-TGATGAGGACAGGTGGATTTTTAGT-3′ |
β-actin | 5′-AGTTGCGTTACACCCTTTCTTGAC-3′ | 171 |
5′-GCTCGCTCCAACCGACTGC-3′ |
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