Genotyping of Mycobacterium tuberculosis Isolates from Hormozgan Province of Iran Based on 15-Locus MIRU-VNTR and Spoligotyping
Table 3
Spoligotype patterns of M. tuberculosis isolates from Hormozgan province.
SIT
Family
No. (%)
Spoligotype pattern
64
LAM6
6 (15.7)
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20
LAM1
3 (7.9)
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26
CAS
3 (7.9)
■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■
53
T1
3 (7.9)
■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■
—
New
3 (7.9)
■■■■□□■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■□□□□■■□□□□■■■■■■■
54
MANU2
2 (5.2)
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520
T1
2 (5.2)
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127
Ural
2 (5.2)
■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□■□□□□■■■■■■■
—
New
2 (5.2)
■□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□■□□□□■■■■■■■
1094
MANU2
1 (2.6)
■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■□□■■■■■■■■■
21
CAS
1 (2.6)
■■■□□□□■■□■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■
22
CAS
1 (2.6)
■■■□□□□■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■
486
CAS
1 (2.6)
■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■
954
CAS
1 (2.6)
■■■□□□□■■■■□■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■
50
H3
1 (2.6)
■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■□□□□■■■■■■■
11
EAI
1 (2.6)
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1
Beijing
1 (2.6)
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—
New
1 (2.6)
■■■□□□□■■■■■■□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■□□□■■■■■■■
—
New
1 (2.6)
□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■□□□■□□□□■■■■■■■
—
New
1 (2.6)
■■□■■■■■□□■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■□■■■■■□■■■
—
New
1 (2.6)
■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□■□■■□■■■■■■
Spoligotype International Type from SITVIT2. Representing spoligotype families annotated in SITVIT2. Number of strains. (■) Presence of spacer; (□) absence of spacer.
