International Journal of Genomics

Research Article

Exploring Heat-Response Mechanisms of MicroRNAs Based on Microarray Data of Rice Post-meiosis Panicle

Table 1

High-confidence miRNA target pairs in rice post-meiosis panicle under the heat stress.
DE-miRNA familiesTarget genes
osa-miR156↑LOC_Os02g04450, LOC_Os03g42320, LOC_Os04g46580, LOC_Os12g27102↓
LOC_Os03g13460↑↓
osa-miR159↓LOC_Os01g48850, LOC_Os03g02240, LOC_Os03g38210↑
osa-miR160↑LOC_Os01g58730, LOC_Os03g14260, LOC_Os05g43910, LOC_Os06g15680, LOC_Os07g37130, LOC_Os08g02996, LOC_Os08g43570, LOC_Os09g29160, LOC_Os11g27400, LOC_Os11g38140↓
osa-miR164↑LOC_Os02g44380, LOC_Os04g41540, LOC_Os06g46270, LOC_Os06g49660↓
osa-miR166↑LOC_Os01g42520, LOC_Os02g45380, LOC_Os03g14260, LOC_Os04g35560, LOC_Os04g39864, LOC_Os05g48850, LOC_Os07g34940, LOC_Os10g40100, LOC_Os11g46860, LOC_Os11g46950↓
osa-miR167↑LOC_Os01g74610, LOC_Os06g03830, LOC_Os06g34040, LOC_Os08g12760↓
osa-miR168↑↓LOC_Os01g19990, LOC_Os01g25300, LOC_Os02g03700, LOC_Os02g21520, LOC_Os04g47870, LOC_Os08g04460↓
LOC_Os01g03270, LOC_Os01g59550, LOC_Os02g10800, LOC_Os02g32200, LOC_Os06g44034, LOC_Os07g49000, LOC_Os08g38610, LOC_Os10g17790↑
osa-miR169↑↓LOC_Os01g52864, LOC_Os02g19970, LOC_Os02g53620, LOC_Os06g05390, LOC_Os10g20990, LOC_Os11g14570↓
LOC_Os01g41650, LOC_Os01g64980, LOC_Os02g54200, LOC_Os03g07880, LOC_Os03g44540, LOC_Os03g46770, LOC_Os04g52550, LOC_Os08g45000, LOC_Os12g42400↑
osa-miR172↓LOC_Os02g56320↑↓
LOC_Os01g52120, LOC_Os02g39410, LOC_Os03g13370, LOC_Os03g50280, LOC_Os04g55560, LOC_Os06g43220, LOC_Os08g39630↑
osa-miR319↑LOC_Os01g60280, LOC_Os08g16660, LOC_Os10g38060↓
osa-miR390↑LOC_Os05g47780, LOC_Os07g37130, LOC_Os11g09940, LOC_Os12g10900↓
LOC_Os08g38410↑↓
osa-miR395↑↓LOC_Os03g07200, LOC_Os03g24844, LOC_Os04g32970, LOC_Os05g37970, LOC_Os08g13800, LOC_Os09g39440↓
LOC_Os05g50624↑↓
LOC_Os01g07110, LOC_Os01g55260, LOC_Os04g31400, LOC_Os04g55730, LOC_Os08g07380, LOC_Os09g25990, LOC_Os12g01850, LOC_Os12g18360, LOC_Os12g27090, LOC_Os12g38380↑
osa-miR396↓LOC_Os01g08560, LOC_Os02g33230, LOC_Os02g47280, LOC_Os02g53690, LOC_Os06g02560, LOC_Os09g34980, LOC_Os11g45410, LOC_Os12g29980↑
osa-miR399↑LOC_Os05g10310, LOC_Os05g30220, LOC_Os08g16580↓
LOC_Os05g45350↑↓
osa-miR408↑LOC_Os01g01400, LOC_Os01g02110, LOC_Os02g43660, LOC_Os03g15600, LOC_Os03g53100, LOC_Os05g42010, LOC_Os06g11490, LOC_Os10g39260↓
osa-miR414↑LOC_Os01g01960, LOC_Os01g13300, LOC_Os01g47430, LOC_Os01g63980, LOC_Os02g03750, LOC_Os03g44430, LOC_Os03g59760, LOC_Os04g30040, LOC_Os04g35760, LOC_Os04g59494, LOC_Os05g51830, LOC_Os05g51860, LOC_Os08g09270, LOC_Os09g36300, LOC_Os10g03660, LOC_Os11g09150, LOC_Os12g01290, LOC_Os12g09580↓
osa-miR415↑LOC_Os02g56550, LOC_Os03g61990↓
osa-miR418↓LOC_Os02g12380, LOC_Os05g22920↑↓
LOC_Os04g35030, LOC_Os04g49270↑
osa-miR419↓LOC_Os08g20000, LOC_Os11g07260↑
osa-miR426↓LOC_Os06g47210↑
osa-miR435↓LOC_Os09g09290↑
osa-miR437↓LOC_Os02g18080, LOC_Os02g36140, LOC_Os02g42350, LOC_Os03g51520, LOC_Os11g42220↑
osa-miR439↓LOC_Os03g14010, LOC_Os06g16200, LOC_Os07g30950↑
osa-miR440↓LOC_Os08g20000↑
osa-miR528↑LOC_Os01g69050, LOC_Os10g06760, LOC_Os10g24094, LOC_Os12g31160↓
LOC_Os10g33104↑↓
osa-miR529↑LOC_Os02g13020, LOC_Os02g39660, LOC_Os04g46580, LOC_Os07g35140, LOC_Os08g35939, LOC_Os10g41870, LOC_Os12g12130↓
LOC_Os12g38110↑↓
osa-miR530↑LOC_Os04g51400, LOC_Os04g59400, LOC_Os11g12290, LOC_Os12g32200, LOC_Os12g44340↓
osa-miR531↑LOC_Os05g33630, LOC_Os06g01590, LOC_Os06g18670, LOC_Os06g20320, LOC_Os06g46690, LOC_Os07g11380, LOC_Os10g07229, LOC_Os12g04110↓
LOC_Os03g13460↑↓
osa-miR535↑LOC_Os03g14880↓
Note: ↑, ↓, and ↑↓ indicate upregulated, downregulated, and up-/downregulated types in rice post-meiosis panicle under the heat stress, respectively.