Exploring Diversity among Norwegian Borrelia Strains Originating from Ixodes ricinus Ticks
Table 2
Characteristics of each housekeeping gene.
Species
Gene
Size (bp)
Avg. G+C content %
PS (%)a
d/d
B. burgdorferi s.s.
clpA
579
52.2
—d
—
—
B. afzelii
0,69
0,001759
0,001810
B. garinii
1,73
0,005484
0,005205
B. valaisiana
0,69
0,003454
0,003768
B. burgdorferi s.s.
clpX
624
56.8
—
—
—
B. afzelii
0,48
0,001255
0,00122
B. garinii
6,08
0,02191
0,001835
B. valaisiana
—e
—
—
B. burgdorferi s.s.
nifS
564
55.8
—
—
—
B. afzelii
0,36
0,00087
0,00090
B. garinii
1,06
0,0054
0,00434
B. valaisiana
—
—
—
B. burgdorferi s.s.
pepX
570
55.6
—
—
—
B. afzelii
0,88
0,00328
0,00223
B. garinii
1,23
0,00484
0,00501
B. valaisiana
—
—
—
B. burgdorferi s.s.
pyrG
603
51.0
—
—
—
B. afzelii
0,83
0,00240
0,00211
B. garinii
1,49
0,00805
0,00609
B. valaisiana
1,32
0,0073
0,00637
B. burgdorferi s.s.
recG
651
53.0
—
—
—
B. afzelii
0,62
0,00209
0,00157
B. garinii
1,54
0,00545
0,00463
B. valaisiana
—
—
—
B. burgdorferi s.s.
rplB
624
56.9
—
—
—
B. afzelii
0,61
0,00261
0,00143
B. garinii
1,28
0,00669
0,00386
B. valaisiana
—
—
—
B. burgdorferi s.s.
uvrA
570
54.4
—
—
—
B. afzelii
0,88
0,00234
0,00223
B. garinii
1,05
0,00335
0,003172
B. valaisiana
—
—
—
Percent polymorphic sites (PS (%)).
bNucleotide diversity ().
cAverage nonsynonymous substitutions versus synonymous substitutions (d/d).
dIt was not possible to perform statistics with only one isolate in this group.
eIt was not possible to perform statistics with only one allele variant.
