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| Name | Locus | Sequence |
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| LBa1 | T-DNA LB | 5′-TGGTTCACGTAGTGGGCCATCG-3′ |
| SP111 | Atku80 | 5′-GAATTCCCCATGGAACAACAACAAGCAGTAGCAG-3′ |
| SP112 | Atku80 | 5′-CTCGACTTAGCTCTCGAGCATTGAC-3′ |
| SP119 | Atku70 | 5′-TGGGTTGCACAAGCACTACTGC-3′ |
| SP120 | Atku70 | 5′-GAATAGCCGGACGGAGTAAAGC-3′ |
| SP205 | T-DNA RB | 5′-ATCAAGCGTATGCAGCCGCC-3′ |
| SP206 | T-DNA RB | 5′-TTTGGAACTGACAGAACCGC-3′ |
| SP207 | Atku80 | 5′-GCGTCTTGGAGCAGGTCTCTTC-3′ |
| SP208 | Atku80 | 5′-GATGAAATCCCCAGCGTTCTCG-3′ |
| Q1 | Atku70 | 5′-TCTACCACTCAGTCAACCTG-3′ |
| Q2 | Atku70 | 5′-CAATAGACAAGCCATCACAG-3′ |
| Roc5.2 | Roc | 5′-GAACGGAACAGGCGGTGAGTC-3′ |
| Roc3.3 | Roc | 5′-CCACAGGCTTCGTCGGCTTTC-3′ |
| SP271 | T-DNA | 5′-CCCGTGTTCTCTCCAAATG-3′ |
| SP272 | T-DNA | 5′-CAGGTCCCCAGATTAGCC-3′ |
| Q8 | BamHI | 5′-GTGACATCTCCACTGACGTAAG-3′ |
| Q9 | BamHI | 5′-GATGAACTTCAGGGTCAGCTTG-3′ |
| Q10 | GFP | 5′-CAAGCTGACCCTGAAGTTCATC-3′ |
| Q11 | GFP | 5′-GTTGTGGCGGATCTTGAAG-3′ |
| SP154 | 5′ PPO | 5′-GGTGGTACTTTTAAGGCAATTCAG-3′ |
| SP155 | 5′ PPO | 5′-GACAGAATTCCGGTGTTTGTAGAC-3′ |
| SP156 | 3′ PPO | 5′-GGTGAGTTAGTGGAAGCAGTTGAC-3′ |
| SP157 | 3′ PPO | 5′-GTCCCATTCAACTATCTTGGTAAG-3′ |
| Bar1 | BAR | 5′-AACCCACGTCATGCCAGTTCC-3′ |
| Bar2 | BAR | 5′-CGGCGGTCTGCACCATCGTC-3′ |
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