Genetic Variation and Population Genetics of Taenia saginata in North and Northeast Thailand in relation to Taenia asiatica
Table 2
Haplotype, nucleotide variation sites of partial cox1 gene (924 bp length), and frequency of 73 Taenia saginata samples in this study (THA*, haplotype A–N) and 33 from 11 different geographical countries** (Haplotype O–W).
Number
Haplotype
Position of nucleotide change
Number of individuals per population
0
0
1
1
2
2
2
3
3
4
5
6
6
6
7
7
7
7
8
8
9
9
9
NL
NH
UB
KK
Subtotal THA*
THA
CHN
KOR
JPN
IND
CAM
NEP
ECU
BRA
ETH
BEL
Total
3
6
7
8
1
3
3
0
8
9
7
2
3
8
1
2
6
9
0
9
0
1
2
9
3
4
6
9
1
7
0
1
2
0
1
9
7
1
3
9
8
6
0
1
2
4
1
A
C
G
G
A
C
A
C
T
A
A
A
G
A
C
T
T
A
T
C
A
C
G
T
10
17
5
6
38
7
2
1
1
2
—
1
1
2
1
1
57
2
B
.
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
T
·
·
·
·
·
·
T
·
·
1
6
3
6
16
3
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
19
3
C
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
T
·
·
1
2
—
—
3
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
3
4
D
·
·
·
G
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
1
2
—
—
3
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
3
5
E
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
G
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
1
1
—
—
2
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
2
6
F
·
·
·
·
·
·
·
·
G
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
—
2
—
—
2
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
2
7
G
·
·
·
·
T
·
·
·
·
·
·
·
·
T
·
·
·
·
·
·
T
·
·
—
1
—
1
2
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
2
8
H
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
C
·
·
·
·
·
·
·
·
—
—
—
1
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
9
I
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
T
·
·
·
·
·
·
—
—
1
—
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
10
J
·
·
·
·
·
·
·
·
G
·
·
·
·
·
·
·
·
C
·
·
·
·
·
1
—
—
—
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
11
K
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
C
·
·
·
1
—
—
—
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
12
L
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
T
·
·
·
·
·
·
·
·
·
—
—
—
1
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
13
M
·
·
·
·
·
·
·
·
G
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
C
T
·
·
—
1
—
—
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
14
N
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
T
·
·
T
·
·
·
A
·
C
T
·
·
—
—
—
1
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
15
O
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
T
·
·
·
·
·
·
T
·
C
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
16
P
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
T
·
·
·
·
·
·
T
·
A
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
17
Q
·
·
·
·
·
·
·
·
·
G
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
18
R
·
A
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
—
1
—
—
—
1
—
—
—
—
—
2
19
S
·
·
A
·
·
G
·
·
·
·
·
A
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
—
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
20
T
·
·
·
·
·
·
T
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
—
1
—
—
—
—
—
—
—
—
—
1
21
U
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
T
·
·
·
·
—
—
—
—
—
—
—
1
—
—
—
1
22
V
T
·
·
·
·
·
T
·
·
·
·
·
·
·
·
C
·
·
·
·
T
·
·
—
—
—
—
—
—
—
—
1
—
—
1
23
W
·
·
·
·
·
·
·
C
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
·
A
·
—
—
—
—
—
—
—
—
—
2
—
2
Dots reprepresent homology with haplotype A sequence. NL: Nan lowland, NH: Nan highland, UB: Ubon Ratchathani, KK: Khon Kaen. 11 countries including THA: Thailand, CHN: China, KOR: Korea, JPN: Japan, IND: Indonesia, CAM: Cambodia, NEP: Nepal, ECU: Ecuador, BRA: Brazil, ETH: Ethiopia, and BEL: Belgium. The numbering of nucleotide position of 1–924 referred to position 400–1324 of the complete mtDNA sequence (1620 bp) of T. saginata (GenBank acc. no. AB066495).