Journal of Pathogens

Research Article

Genotype Cluster Analysis in Pathogenic Escherichia coli Isolates Producing Different CDT Types

Table 2

The occurrence of virulence-associated genes including plasmid, Pathogenicity Island, chromosomal and phage genes. (+) indicates positive PCR product and the existence of mentioned gene while (−) indicates negative PCR product.
Strain espP etpD katP sfpA Hly fliC fimH cdt-I cdt-II cdt-III cdt-IVcdt-Vstx1 stx2
1 − + + + − + + + − − − − − −
2 − − − − − − + + − − − − + −
3 − − + − − + + + − − − − + −
4 + − + − − + + + − − − − + −
5 − − + − − + + + − − − − + +
6 − + + − − + + + − − − − + +
7 − + + + − + + − + − − − + −
8 − + + − − + + − + − − − + −
9 − − + − + + + − + − − − + −
10 − + + − − + + − + − − − + −
11 − + + − − + + − + − − − + −
12 − + + − − + + − + − − − + −
13 − + − − − + + − + − − − + −
14 + − + − − + + − − + − − − −
15 + − + − + + + − − + − − − −
16 − + + − + + + − − + − − − −
17 + − − + − + + − − + − − + −
18 − − + − + + + − − + − − + −
19 − − − − + + + − − + − − + +
20 − + − − + + + − − + − − + −
21 + + + + − + + − − − + − + −
22 − − + + + + + − − − + − + −
23 − + − − − + + − − − + − + −
24 + + + − + + + − − − + − + +
25 − + − + + + + − − − + − + −
26 − − − − − + + − − − + − + −
27 − − + − + + + − − − + − + −
28 + − − − − + + − − − − + + −
29 − + − + + + + − − − − + + −
30 − + − + + + + − − − − + + −