Research Article
Tuberculosis Drug Susceptibility, Treatment, and Outcomes for Belarusian HIV-Positive Patients with Tuberculosis: Results from a National and International Laboratory
Table 3
Individual results of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) drug-susceptibility testing performed in two different laboratories (Belarus vs. Denmark) for 30 TB/HIV patients from Minsk, Belarus.
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Abbreviations: PID = patient’s identification number. DST = drug susceptibility testing. LPA = line probe assay. Pheno = phenotypic resistance. R = resistant. S = sensitive. WGS = whole-genome sequencing. Genotypic resistance was determined by detection of mutations in the inhA/katG genes for isoniazid, in the rpoB gene for rifampicin, in the embB gene for ethambutol, and in the pncA gene for pyrazinamide. For second-line drugs, resistance was determined for a drug class by detection of the following mutations: aminoglycosides (amikacin, capreomycin, and kanamycin) in the rrs and eis genes; streptomycin in the rpsL gene; fluoroquinolones (moxifloxacin, levofloxacin, and ofloxacin) in the gyrA and gyrB genes. EAS = Euro-American superlineage, LAM = Latin American-Mediterranean lineage. In Minsk, DST was performed at the Republican Scientific and Practical Center for Pulmonology and TB, Minsk, Belarus. In Copenhagen, DST was performed at the WHO TB Supranational Reference Laboratory, Copenhagen, Denmark. Drug-sensitive TB = Mtb sensitive to all first-line anti-TB drugs. Monoresistant TB = Mtb resistant to one first-line anti-TB drug only. Multidrug resistant TB = Mtb resistant to at least both isoniazid and rifampicin. Preextensive drug resistance = Mtb resistant to isoniazid and rifampicin and either to any fluoroquinolone or a second-line injectable agent but not to both. Extensive drug resistance = Mtb resistant to isoniazid and rifampicin and to any fluoroquinolone and to at least one of three second-line injectable drugs. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||