Performance of Glutamate Dehydrogenase and Triose Phosphate Isomerase Genes in the Analysis of Genotypic Variability of Isolates of Giardia duodenalis from Livestocks
Table 2
Overlapped nucleotides in isolates from cattle and sheep characterized as E and BIII genotyping by tpi.
Isolates
AF069561*
AY228645*
LaNUdi001**
LaNUdi007***
CaNUdi003**
CaNUdi006**
CaNUdi008**
Nucleotides positions and replacements
347
C
T
T
·
·
·
·
350
C
T
A
·
·
·
·
374
G
A
A
·
·
·
·
396
C
T
T
T
·
·
·
397
T
C
C
·
·
·
·
398
T
C
C
·
·
·
·
405
C
T
·
T
·
·
·
408
T
A
A
·
·
·
·
411
T
A
A
·
·
·
·
426
G
A
A
A
·
·
·
429
T
C
C
C
·
·
·
432
T
G
G
·
·
·
·
439
T
T
C
·
·
·
·
440
G
A
A
·
·
·
·
442
C
T
T
·
·
·
·
462
C
T
T
·
·
·
·
468
T
C
C
·
·
·
·
471
G
A
A
·
·
·
·
473
A
G
G
·
·
·
·
483
T
A
A
·
·
·
·
495
C
T
T
·
·
·
·
501
A
G
·
·
A
A
A
504
C
T
T
·
·
·
·
507
C
T
T
·
·
C
·
518
T
A
A
·
·
·
·
528
G
C
·
·
T
T
·
529
C
T
T
·
·
·
·
532
A
A
A
·
A
A
·
533
G
A
·
·
·
G
·
534
C
G
·
·
C
C
·
535
C
T
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·
C
C
537
T
C
·
·
T
T
T
540
A
G
·
·
A
A
·
548
G
G
·
·
A
A
·
549
A
G
G
·
·
·
·
552
C
T
T
·
·
C
·
561
A
G
·
·
A
A
·
583
A
G
·
·
A
·
·
585
T
C
·
·
T
·
·
597
T
C
C
·
·
·
·
606
G
T
T
·
·
·
·
618
G
A
·
·
G
G
G
624
A
G
·
·
·
A
·
625
G
G
·
·
·
·
A
627
T
G
·
·
T
T
T
633
T
G
G
·
·
·
·
642
C
T
·
·
·
C
·
645
C
T
·
·
C
C
·
647
C
T
G
·
·
·
·
693
A
A
·
G
·
·
·
*AF069561: assemblage BIII; *AY228645: assemblage E; **isolates identified as assemblage BIII, ***isolates identified as assemblage E; dots indicate identity to the reference sequences.
