The Human Cell Surfaceome of Breast Tumors

Table 2

Evaluation of breast cell surface overexpressed genes according to ONCOMINE studies of grade, stage, and prognosis in breast tumors.

Stage^2

Prognosis

Grade^1

T

N

M

Survival^3

Disease-free survival^4

Bittner

Chin

Desmedt

Farmer

Finak

Ginestier

Hess

Kreike

Ma

Miller

Pollack

Sorlie

Sotiriou

Sotiriou

Zhao

Bittner

Sorlie

Sorlie

Bittner

Hess

Sorlie

Sorlie

Sotiriou

Turashvili

Yu

Sorlie

Bild

Desmedt

Pawitan

Sorlie

VandeVijver

Ma

Wang

Wang

Van de Vijver

VandeVijver

SQLE

X

X

X

—

—

X

X

X

—

X

—

—

—

X

X

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

X

—

X

X

X

X

CNOT1

X

X

X

X

—

X

X

—

—

X

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

X

—

X

X

—

—

TMEM132A

X

—

X

X

—

X

X

—

—

X

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

X

—

X

X

—

PTDSS1

X

—

X

—

—

X

X

—

—

X

—

X

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

X

—

—

—

X

X

RPN2

X

—

X

X

X

X

X

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

X

X

SLC2A1

X

—

X

X

—

X

—

—

—

X

—

—

—

X

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

X

X

GPR172A

X

—

X

X

—

X

X

—

—

X

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

MMP15

—

—

—

X

—

—

X

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

X

—

X

—

—

—

X

X

UNC93B1

X

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

X

X

C6orf129

X

—

—

—

—

X

—

—

X

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

NRM

X

—

—

—

—

X

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

X

—

SLC10A3

X

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

X

X

CD72

X

—

X

—

—

—

—

—

X

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

TNFRSF12A

X

—

—

—

—

X

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

IFI6

X

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

X

BRI3

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

X

—

SCARB1

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

X

X

PERLD1

—

X

—

—

—

—

X

—

—

X

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

TRPV2

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

X

—

—

X

—

ORMDL3

X

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

C19orf28

X

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

PAQR4

X

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

TM9SF1

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

MMP14

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

X

—

—

—

PTPRU

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

TMEM109

X

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

P2RY11

—

—

—

X

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

UPK1A

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

CADM4

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

TYROBP

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

FXYD5

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

SPINT2

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

X

SYNGR2

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

X

TMPRSS4

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

X

ORAI1

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

ZDHHC12

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

SDC4

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

SDC3

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

TMEM184B

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

TOR1AIP2

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

TMEM147

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

TMED3

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

—

TREM2

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

—

—

SLC15A3

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

VSIG4

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

—

ANKH

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

ATP13A2

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

DEGS2

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

TNFRSF19

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

—

—

TMEM134

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

—

X

—

—

1Compares lower with higher grade samples.
²Compares samples derived from Tn with Tn + x (T); Nx with Nx + 1 (N); and Mx with Mx + 1 (M).
³Compares  samples derived from live and dead patients within 5 years.
⁴Compares samples derived from patients without and with relapse/recurrence in 5 years.
X: means overexpression in a given study (𝑃<0.01).