Phylogenetic Analysis of Stenotrophomonas spp. Isolates Contributes to the Identification of Nosocomial and Community-Acquired Infections

Table 2

API 20 NE biochemical profile of Stenotrophomonas spp. phylogenetically close subgroups shown in Figure 1 or Figure 4.

Phylogenetic groups		Strains	Biochemical profile
Figure 1	Figure 4		NO3	ADH	URE	PNPG
B.III.3	B.IV.3	HIAE 1998	−	−	−	+
		HIAE 2229	−	−	−	+
		HIAE 2425	−	−	−	+
		LMG 11114	−	−	−	+
B.III.2	B.IV.2	HIAE 3673	+	+	−	+
		LMG 11002	−	−	+	−
		HIAE 3730	−	−	−	−
		HIAE 4003	+	−	−	+
B.III.1	B.IV.1	HIAE 5124	−	+	−	+
		HIAE 3369	+	+	−	+
		LMG 957	+	−	−	+
		LMG 10853	−	−	+	+
		HIAE 2336	−	−	−	+
B.II	B.III	HIAE 3338	−	−	−	+
		HIAE 3576	−	−	−	−
		HIAE 4600	+	−	−	+
		HIAE 4500	−	−	−	+
		HIAE 4800	−	−	−	+
		HIAE 3808	−	−	−	+
		HIAE 5399	−	−	−	+
B.I	B.II	HIAE 4920	−	−	−	−
		HIAE 4249	−	−	−	−
		HIAE 1911	−	−	−	+
		HIAE 4948	−	−	−	+
		HIAE 3182	+	−	−	+
		HIAE 1990	−	−	−	−
		LMG 958	+	−	−	+
		HIAE 5188	+	−	−	+
		LMG 10992	+	−	+	−
		HIAE 4638	+	−	−	+
		HIAE 2505	−	−	−	−
		HAIE 2737	−	−	−	−

NO₃: Potassium nitrate, ADH: L-arginine, URE: urea, and PNPG: 4-nitrophenyl β-D-galactopyranoside.
All strains were negative for the following: TRP: L-tryptophane, GLU: D-glucose (fermentation), ARA: L-arabinose, MAN: D-mannitol, GNT: potassium gluconate, CAP: capric acid, ADI: adipic acid, PAC: phenylacetic acid, and OX: oxidase and positive for the following: ESC: esculin, GEL: gelatin, GLU: D-glucose (assimilation), MNE: D-mannose, NAG: N-acetyl-glucosamine, MAL: D-maltose, MLT: malic acid, and CIT: trisodium citrate.
Strains LMG 25348, HIAE 2947, and HIAE 4471 were not tested.