Genotypic Diversity of Mycobacterium tuberculosis Clinical Isolates in the Multiethnic Area of the Xinjiang Uygur Autonomous Region in China

Table 2

Spoligotypes of prevalent clades by SITVIT2 in this study.

Number	Spoligotype	SIT	Family
1	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■	1	Beijing	212
2	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■□■■■	190	Beijing	5
3	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■□■■■■■	632	Beijing	2
4	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■	585	Beijing-like	1
5	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■□□□□□■■■	—	Beijing-like	1
6	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■	—	Beijing-like	1
7	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■□■	1674	Beijing	1
8	□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■□□	—	Beijing-like	1
9	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■	52	T2	5
10	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	53	T1	9
11	■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	196	T1	1
12	■■■■□■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	1221	T1	1
13	■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■□■■■	153	T2	1
14	■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	76	T2	2
15	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	86	T1	1
16	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	42	LAM9	1
17	■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□■■■■■■■■■	1096	MANU2	1
18	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□■□□□□■■■■■■■	50	H3	1
19	■□■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□■□□□□■■■■■■■	127	H4	7
20	■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■■■■□□□■□□□□■■■■■■■	35	H4	2
21	■■■□□□□■■□■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■□□■■■■■	1314	CAS1-DELHI	1
22	■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■	26	CAS1-DELHI	2
23	■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■□□■■■■■	29	CAS1-DELHI	3
24	■■■□□□□■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□□■■	1777	CAS1-DELHI	1
25	■■■□□□□□■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■	—	CAS1-DELHI	1
26	■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□■■■■■■■	357	CAS	2
27	■■■□□□□□■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□■■■■■■■■■	1551	CAS	1
28	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□■■■■■■■	1378	CAS	1
29	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□■■■	—	U	1
30	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□■■■■■■	240	U	2
31	■■■■■■■□■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	—	U	1
32	■■■■■■□□■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■□□□□■■■■■■■	—	U	1
33	■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■■□□□□□□■■■■■■	519	U	1
34	■■■□□□□■■■■■■■■■■■■■■■□□■■■■■■■■■□□□□■■■■■■	27	U	1
35	■■■■■■■■■■■■□■■■■■■■■■■■□□□□□□□□□□□□□□□□□□□	56	U	2

Presence of spacer (■); absence of spacer (□).
Representing spoligotype families as assigned in SITVIT2.
N: number of strains.