Genome-Wide Investigation and Expression Profiling of HD-Zip Transcription Factors in Foxtail Millet (Setaria italica L.)

Table 1

Feature list of 47 genes identified in foxtail millet and their sequence characteristics.

NIPGR ID	Phytozome Identifier	Physical position on foxtail millet genome			Protein length (aa)	PI	Molecular weight (Da)	Intron	Phylogeny group
		Chromosome	Start position (bp)	End position (bp)
Sihdz01	Seita.1G087900	1	7798792	7799706	223	9.63	24184.04	1	I
Sihdz02	Seita.1G088000	1	7808171	7809619	220	9.58	23994.74	1	I
Sihdz03	Seita.1G201700	1	28159965	28165140	327	6.1	36098.44	3	I
Sihdz04	Seita.1G253700	1	32918259	32922133	236	5.4	26468.23	1	II
Sihdz05	Seita.1G306100	1	36983614	36985721	324	4.6	35439.06	3	II
Sihdz06	Seita.1G335800	1	39351189	39355603	711	6.2	77892.71	9	IV
Sihdz07	Seita.2G112400	2	10947386	10950661	735	6.4	79319.1	7	IV
Sihdz08	Seita.2G114000	2	11221021	11225092	712	6.21	78529.74	7	IV
Sihdz09	Seita.2G193200	2	28965749	28968902	303	4.65	32897.23	2	II
Sihdz10	Seita.2G224000	2	32601420	32603671	352	6.06	36851.92	3	I
	Seita.2G224000.2	2	32601420	32603671	419	9.69	43426.69
	Seita.2G224000.3	2	32601420	32603671	313	9.32	33026.8
Sihdz11	Seita.2G236800	2	34125151	34127695	265	4.82	28604.67	2	II
Sihdz12	Seita.2G282200	2	37895221	37901754	860	6.17	91157.98	8	IV
Sihdz13	Seita.2G284000	2	38029446	38031046	237	5.3	26082.92	1	II
Sihdz14	Seita.2G368600	2	44278030	44279425	230	6.02	25541.64	2	II
Sihdz15	Seita.3G395000	3	49640251	49646758	853	6.37	92896.04	17	III
Sihdz16	Seita.4G029000	4	1875175	1876650	271	9.4	28195.86	1	I
Sihdz17	Seita.4G029200	4	1896185	1897677	291	9.15	30526.21	1	I
Sihdz18	Seita.4G084600	4	6822689	6826925	699	5.89	75992.54	9	IV
Sihdz19	Seita.4G245400	4	36871689	36872853	223	9.28	24394.21	2	I
Sihdz20	Seita.5G079000	5	6743029	6750110	806	5.3	86426.43	8	IV
Sihdz21	Seita.5G141300	5	12454752	12459714	855	5.56	92530.12	16	III
Sihdz22	Seita.5G241600	5	30455176	30458970	224	9.35	24654.92	3	I
Sihdz23	Seita.5G326100	5	37528162	37531618	800	6.3	85890.61	8	IV
Sihdz24	Seita.5G344800	5	38943201	38948786	710	8.5	78461.92	10	IV
Sihdz25	Seita.6G039900	6	3018210	3023859	785	5.69	84606.48	9	IV
Sihdz26	Seita.6G072700	6	6484850	6490160	793	5.6	85138.95	6	IV
Sihdz27	Seita.6G145000	6	25873860	25878078	280	4.81	30601.69	2	II
Sihdz28	Seita.6G176400	6	30029766	30031922	355	7.06	36870.92	3	I
	Seita.6G176400.2	6	30029766	30031922	353	6.68	36614.61
Sihdz29	Seita.6G187700	6	31175081	31177598	279	4.83	29580.76	3	II
Sihdz30	Seita.7G060900	7	16153965	16157882	715	6.07	78947.15	6	IV
Sihdz31	Seita.7G061100	7	16176368	16179683	730	6.01	80631.47	7	IV
Sihdz32	Seita.7G063300	7	16569209	16575494	674	6.3	74387.26	8	IV
Sihdz33	Seita.7G184600	7	26206329	26207830	335	6.6	37451.98	2	II
Sihdz34	Seita.7G187800	7	26435171	26436840	237	9.06	26043.72	3	I
Sihdz35	Seita.7G203300	7	27549926	27555890	793	5.87	85333.81	8	IV
Sihdz36	Seita.7G246700	7	30566314	30572371	781	5.48	84480.42	9	IV
Sihdz37	Seita.9G158800	9	10515531	10521227	856	6.16	93049.81	17	III
Sihdz38	Seita.9G219700	9	16264055	16271199	839	5.83	91968.72	17	III
Sihdz39	Seita.9G248400	9	19579512	19581764	299	5.1	32729.64	2	II
Sihdz40	Seita.9G258100	9	21176272	21178630	366	6.21	38925.15	1	II
Sihdz41	Seita.9G301000	9	34846306	34848095	247	8.69	27267.91	2	I
Sihdz42	Seita.9G309800	9	35775895	35781959	871	5.47	93247.34	9	IV
	Seita.9G309800.2	9	35775895	35781959	881	5.43	94315.57
Sihdz43	Seita.9G321500	9	36997661	37000034	352	8.93	37940.91	3	I
	Seita.9G321500.2	9	36997661	37000034	347	8.79	37374.21
Sihdz44	Seita.9G481800	9	52201230	52203593	278	8.07	29367.01	2	I
Sihdz45	Seita.9G511500	9	54329497	54331803	313	4.78	34357.78	2	II
Sihdz46	Seita.9G524200	9	55216547	55218989	335	6.07	36879.97	2	II
Sihdz47	Seita.9G572600	9	58368642	58376046	840	5.93	92167.29	17	III