Rapid and Simple Detection of Trichosporon asahii by Optimized Colony PCR
Table 1
Strains used in this study and the specificity evaluation of species-specific primers for detecting T. asahii.
Organism
Strain
Specificity detection
TA1
TA2
TA3
TA4
Trichosporon asahii
BZP7001
+
+
+
+
Trichosporon asahii
BZP7002
+
+
+
+
Trichosporon asahii
BZP7003
+
+
+
+
Trichosporon asahii
BZP7004
+
+
+
+
Trichosporon asahii
BZP7005
+
+
+
+
Trichosporon asahii
BZP9001
+
+
+
+
Trichosporon asahii
BZP9002
+
+
+
+
Trichosporon asahii
CBS2479
+
+
+
+
Trichosporon asahii
BZP4848
+
+
+
+
Trichosporon asahii
BZP6108
+
+
+
+
Trichosporon asahii
BZP6198
+
+
+
+
Trichosporon asahii
BZP6674
+
+
+
+
Trichosporon asahii
CBS7137
+
+
+
+
Trichosporon asahii
CBS8520
+
+
+
+
Trichosporon asahii
CBS8904
+
+
+
+
Trichosporon debeurumanianum
CBS1896
−
−
−
−
Trichosporon dermatis
CBS2043
−
−
−
−
Trichosporon cutaneum
CBS2466
−
−
−
−
Trichosporon asteroides
CBS2481
−
+
+
−
Trichosporon coremiiforme
CBS2482
−
+
+
−
Trichosporon faecale
CBS4828
−
+
+
−
Trichosporon inkin
CBS5585
−
−
−
−
Trichosporon jirovecii
CBS6864
−
−
−
−
Trichosporon ovoides
CBS7556
−
−
−
−
Trichosporon mucoides
CBS7625
−
−
−
−
Trichosporon montevideense
CBS8261
−
+
+
−
Trichosporon domesticum
CBS8280
−
−
−
−
Trichosporon japonicum
CBS8641
−
+
−
−
Trichosporon lactis
CBS9051
−
−
−
−
Trichosporon dohaense
CBS10761
−
−
−
−
Candida dubliniensis
CMCC(F)C8f
−
−
−
−
Candida tropicalis
CMCC(F)C2f
−
−
−
−
Candida parapsilosis
CMCC(F)C4f
−
−
−
−
Candida glabrata
CMCC(F)T10a
−
−
−
−
Candida metapsilosis
CMCC(F)C4k
−
−
−
−
Candida albicans
ATCC90028
−
−
−
−
Cryptococcus neoformans
CMCC(F)D2a
−
−
−
−
Cryptococcus gattii
CMCC(F)D2e
−
−
+
−
Trichophyton rubrum
CMCC(F)T1h
−
−
−
−
Trichophyton violaceum
BZP1501
−
−
−
−
Trichophyton mentagrophytes
CMCC(F)T5e
−
−
−
−
Malassezia furfur
CMCC(F)T17a
−
−
−
−
Malassezia sympodialis
CMCC(F)T14a
−
−
−
−
Sporothrix schenkii
CMCC(F)D1a
−
−
−
−
Microsporum gypseum
CMCC(F)M2b
−
−
−
−
Microsporum canis
CMCC(F)M3h
+
−
−
−
Aspergillus versicolor
CMCC(F)A5c
−
−
−
−
Aspergillus fumigatus
CMCC(F)A1g
+
−
−
−
Aspergillus niger
CMCC(F)A3a
−
−
−
−
Aspergillus nidulans
CMCC(F)A7c
−
−
−
−
Fonsecaea pedrosoi
CMCC(F)D6j
+
−
−
−
Phialophora verrucosa
CMCC(F)D8i
−
−
−
−
Scedosporium apiospermum
CMCC(F)D13f
−
−
−
−
Penicillium marneffei
CMCC(F)B33a
−
−
−
−
Rhizopus oryzae
CMCC(F)B81c
−
−
−
−
Mucor circinelloides
CMCC(F)B57a
−
−
−
−
Fusarium oxysporum
CMCC(F)B38c
−
−
−
−
Absidia Corymbifera
CMCC(F)B69f
−
−
−
−
Staphylococcus aureus
Clinical isolates
−
−
−
−
Staphylococcus epidermidis
Clinical isolates
−
−
−
−
Streptococcus pneumoniae
Clinical isolates
−
−
−
−
Streptococcus pyogenes
Clinical isolates
−
−
−
−
Klebsiella pneumonia
Clinical isolates
−
−
−
−
Escherichia coli
Clinical isolates
−
−
−
−
Acinetobacter baumannii
Clinical isolates
−
−
−
−
Enterococcus faecium
Clinical isolates
−
−
−
−
Serratia odorifera
Clinical isolates
−
−
−
−
Healthy human DNA
−
−
−
−
Negative control
−
−
−
−
ATCC: American type culture collection, Rockville, MD, USA; CBS: Centraalbureau voor Schimmelcultures, Baarn, The Netherlands; CMCC: China Medical Culture Collection, Nanjing, China; BZP: The Military Institute of Injury and Reparation, China.