Review Article
Bioinformatic HLA Studies in the Context of SARS-CoV-2 Pandemic and Review on Association of HLA Alleles with Preexisting Medical Conditions
Table 1
Bioinformatic prediction HLA alleles with high binding affinity with different SARS-CoV-2 peptides.
(a) |
| MHC I |
| | 01 : 01 | 02 : 01 | 02 : 02 | 02 : 03 | 02 : 04 | 02 : 05 | 02 : 06 | 02 : 07 | 02 : 17 | 03 : 01 | 11 : 01 | 23 : 01 | 24 : 02 | 24 : 07 | 24 : 10 | 24 : 23 | 25 : 01 | 26 : 01 | 29 : 01 | 29 : 02 | 30 : 01 | 30 : 02 | 31 : 01 | 32 : 01 | 33 : 01 | 33 : 02 | 33 : 03 | 34 : 01 | 66 : 01 | 68 : 01 | 68 : 02 |
| | 07 : 02 | 07 : 05 | 08 : 01 | 14 : 02 | 15 : 01 | 15 : 02 | 15 : 03 | 15 : 21 | 18 : 01 | 27 : 02 | 27 : 05 | 35 : 01 | 35 : 02 | 35 : 03 | 35 : 05 | 35 : 30 | 37 : 01 | 38 : 01 | 39 : 01 | 39 : 02 | 40 : 01 | 44 : 02 | 44 : 03 | 46 : 01 | 51 : 01 | 51 : 02 | 51 : 03 | 52 : 01 | 53 : 01 | 54 : 01 | 56 : 01 | 56 : 07 | 57 : 01 | 57 : 03 | 58 : 01 |
| | 01 : 02 | 02 : 01 | 03 : 01 | 03 : 03 | 03 : 04 | 04 : 01 | 05 : 01 | 06 : 02 | 07 : 01 | 07 : 02 | 08 : 01 | 12 : 02 | 12 : 03 | 14 : 02 | 14 : 03 | 15 : 02 |
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(b) |
| MHC II |
| | 01 : 01 | 01 : 02 | 01 : 13 | 03 : 01 | 03 : 05 | 03 : 06 | 03 : 07 | 03 : 08 | 03 : 09 | 03 : 11 | 04 : 01 | 04 : 02 | 04 : 04 | 04 : 05 | 04 : 08 | 04 : 10 | 04 : 21 | 04 : 23 | 04 : 26 | 07 : 01 | 07 : 03 | 08 : 01 | 08 : 02 | 08 : 04 | 08 : 06 | 08 : 13 | 08 : 17 | 09 : 01 | 10 : 01 | 11 : 01 | 11 : 02 | 11 : 04 | 11 : 06 | 11 : 07 | 11 : 14 | 11 : 20 | 11 : 21 | 11 : 28 | 12 : 01 | 13 : 01 | 13 : 02 | 13 : 04 | 13 : 05 | 13 : 07 | 13 : 11 | 13 : 21 | 13 : 22 | 13 : 23 | 13 : 27 | 13 : 28 | 13 : 41 | 14 : 31 | 15 : 01 | 15 : 02 | 15 : 03 | 15 : 06 | 16 : 01 | 16 : 02 |
| | 01 : 01 | 02 : 02 | 03 : 01 |
| | 01 : 01 | 01 : 03 |
| | 01 : 01 | 01 : 05 |
| | 01 : 01 |
| | 01 : 03 | 02 : 01 | 03 : 01 |
| | 01 : 01 | 02 : 01 | 03 : 01 | 04 : 01 | 04 : 02 | 05 : 01 | 06 : 01 | 14 : 01 |
| | 01 : 01 | 01 : 02 | 01 : 03 | 01 : 04 | 02 : 01 | 03 : 01 | 04 : 01 | 04 : 02 | 05 : 01 | 06 : 01 |
| | 02 : 01 | 02 : 02 | 03 : 01 | 03 : 02 | 03 : 03 | 04 : 01 | 04 : 02 | 05 : 01 | 05 : 03 | 06 : 02 | 06 : 03 |
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