Mucosa-Associated Escherichia coli in Colorectal Cancer Patients and Control Subjects: Variations in the Prevalence and Attributing Features

Table 3

Distribution of cyclomodulin-positive E. coli according to phylogenetic groups.

Percentage (number) of E. coli strains from CRC patients in diverse phylogenetic groups
	A (n = 9)	B1 (n = 5)	B2 (n = 24)	D (n = 27)	E (n = 0)	F (n = 0)	All (n = 65)
cif	22.2 (2)	20 (1)	8.3 (2)	22.2 (6)	0 (0)	0 (0)	16.9 (11)
cnf1	0 (0)	0 (0)	16.7 (4)	14.8 (4)	0 (0)	0 (0)	12.3 (8)
pks	0 (0)	0 (0)	25 (6)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	9.2 (6)
cdt	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)
Cyclomodulin-encoding genes	22.2 (2)	20 (1)	50 (12)	37 (10)	0 (0)	0 (0)	30.7 (20)
Percentage (number) of E. coli strains from the control group in diverse phylogenetic groups
	A (n = 16)	B1 (n = 8)	B2 (n = 5)	D (n = 7)	E (n = 4)	F (n = 2)	All (n = 42)
cif	6.2 (1)	0 (0)	0 (0)	14.3 (1)	0 (0)	0 (0)	4.7 (2)
cnf	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)
pks	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)
cdt	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)	0 (0)
Cyclomodulin-encoding genes	6.2 (1)	0 (0)	0 (0)	14.3 (1)	0 (0)	0 (0)	4.7 (2)

Some E. coli isolates carried more than one cyclomodulin-encoding genes.