Research Article
Gene Selection via a New Hybrid Ant Colony Optimization Algorithm for Cancer Classification in High-Dimensional Data
Table 6
Comparison of SVM, 1NN, MWIS-1NN, and MWIS-ACO-LS (LOOCV).
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Note: the best results are shown in bold. Remark: as the SVM, 1NN, and MWIS are of deterministic nature, the classification is calculated just in one run. Accuracy: the classification accuracy using LOOCV (leave-one-out-cross-validation). Genes: the number of genes used in the classification ofthe LR-L1 and LR-Elasticnet methods. Best: the best result found in all ten runs. Avg: the average of the ten experiments. Time: the execution time in minutes. SVM: the support vector machine classifier using a linear kernel. LR-L1: the logistic regression classifier with the lasso regularisation. LR-Elasticnet: the logistic regression classifier with the elastic net regularisation. 1NN: the 1-nearest neighbor classifier. MWIS: the maximum weight independent set for gene selection. MWIS-ACO: our method of selection combining MWIS and ACO without using LS. MWIS-ACO-LS: our improved method of selection combining MWIS and ACO and the local search algorithm (LS). |