Identification of Yellow Pigmentation Genes in Brassica rapa ssp. pekinensis Using Br300 Microarray

Table 3

Genes expressed specifically in either yellow or white inner leaves.

Expression pattern	Gene name	Br SEQ ID	At locus	PI value		RT-PCR
				White	Yellow	W	Y
Yellow specific	Unknown protein	Brapa_ESTC005061	At4g30660	37	11,124
	Chitinase	Brapa_ESTC005522	At3g47540	34	13,990
	CA18	Brapa_ESTC013802	At5g14740	38	8,063
	Dynein light chain	Brapa_ESTC010078	At4g27360	124	20,072
	Unknown protein	Brapa_ESTC010121	At4g10300	24	3,243
	Reductase	Brapa_ESTC013704	At5g52100	462	18,255
	Calcium binding	Brapa_ESTC035004	At1g15860	497	11,041
	APX4	Brapa_ESTC013724	At4g09010	437	12,439
	SHM2	Brapa_ESTC017490	At5g26780	466	4,033
	SBPase	Brapa_ESTC047526	At3g55800	440	7,571
	Thylakoid protein	Brapa_ESTC011620	At5g52970	456	6,459
	Unknown protein	Brapa_ESTC006516	At3g19800	458	4,961
		Brapa_ESTC048334	no_hits	13	21,498
		Brapa_ESTC042517	no_hits	16	25,294
		Brapa_ESTC028538	no_hits	32	16,831
		Brapa_ESTC006072	no_hits	13	4,401
		Brapa_ESTC000684	no_hits	91	28,921
		Brapa_ESTC041578	no_hits	86	17,882
		Brapa_ESTC002681	no_hits	175	29,165
		Brapa_ESTC002391	no_hits	197	27,114
		Brapa_ESTC048903	no_hits	403	15,662
		Brapa_ESTC002008	no_hits	444	19,448
White specific	Thaumatin protein	Brapa_ESTC024359	At4g36010	7,666	125
		Brapa_ESTC002914	no_hits	5,441	62
		Brapa_ESTC048544	no_hits	2,635	27
		Brapa_ESTC028228	no_hits	1,891	21
	BrACT1