Whole-Genome Duplication and Purifying Selection Contributes to the Functional Redundancy of Auxin Response Factor (ARF) Genes in Foxtail Millet (Setaria italica L.)
Table 1
The characteristics of identified auxin response factor gene family in Setaria italica.
Gene namea
Locus
Chr location
AAb
PIc
MW (kDa)d
SiARF1
Seita.1G077200
1 : 6988237…6994473
907
5.45
99.6988
SiARF2
Seita.1G090900
1 : 8014277…8022232
1133
5.9
125.4214
SiARF3
Seita.1G195500
1 : 27687425…27693427
673
5.76
74.9183
SiARF4
Seita.1G241500
1 : 31927733…31930605
696
6.86
74.5453
SiARF5
Seita.3G003300
3 : 165345…168218
502
5.75
54.4367
SiARF6
Seita.3G020000
3 : 1162915…1171149
835
6.3
92.7573
SiARF7
Seita.3G028100
3 : 1711500…1718231
937
5.79
103.1312
SiARF8
Seita.3G147000
3 : 10559752…10564250
577
9.14
64.2633
SiARF9
Seita.3G179300
3 : 13481507…13487361
579
8.33
64.254
SiARF10
Seita.3G321500
3 : 40156717…40163068
841
6.25
92.7379
SiARF11
Seita.3G394000
3 : 49527955…49534308
897
5.66
98.8577
SiARF12
Seita.4G040100
4 : 2680871…2687694
1054
6.09
116.3922
SiARF13
Seita.4G240600
4 : 36454278…36462936
1084
6.12
120.7337
SiARF14
Seita.4G257800
4 : 37696236…37700051
686
7.05
74.697
SiARF15
Seita.4G262300
4 : 38057919…38064263
931
5.95
102.7815
SiARF16
Seita.5G004300
5 : 322788…327036
687
5.59
76.8788
SiARF17
Seita.5G265200
5 : 32737893…32742338
667
6.42
73.7489
SiARF18
Seita.5G321300
5 : 37047017…37052916
685
6.84
74.7693
SiARF19
Seita.5G438100
5 : 45465923…45471577
809
6.01
90.7756
SiARF20
Seita.6G212000
6 : 32960180…32967624
1099
6.13
121.6518
SiARF21
Seita.7G108100
7 : 20883066…20888476
663
5.59
73.4238
SiARF22
Seita.7G169600
7 : 25114768…25117902
677
8.05
72.674
SiARF23
Seita.8G135700
8 : 26264640…26270855
811
6.6
90.0333
SiARF24
Seita.9G219800
9 : 16301628…16306053
684
6.71
74.705
aThe name of a gene named according to its order on the chromosome. bProtein sequence length. cIsoelectric point. dMolecular weight.
