Analysis of lncRNA, miRNA, and mRNA Expression Profiling in Type I IFN and Type II IFN Overexpressed in Porcine Alveolar Macrophages

Table 3

Gene list of pairs of lncRNA-miRNA-mRNA.

lncRNA- (downregulated-) miRNA- (upregulated-) gene (downregulated) pairs
lncRNA gene_id	sRNA	gene_name
XLOC_222640	ssc-miR-193a-5p	RNPS1
XLOC_047290	Ssc-miR-365-5p	DNAJB6
XLOC_047290	ssc-miR-365-5p	KRT14
XLOC_047290	ssc-miR-365-5p	RNPS1
XLOC_147777	ssc-miR-365-5p	DNAJB6
XLOC_147777	ssc-miR-365-5p	KRT14
XLOC_147777	ssc-miR-365-5p	RNPS1
ENSSSCG00000036379	ssc-miR-365-5p	DNAJB6
ENSSSCG00000036379	ssc-miR-365-5p	KRT14
ENSSSCG00000036379	ssc-miR-365-5p	RNPS1
XLOC_162298	ssc-miR-365-5p	DNAJB6
XLOC_162298	ssc-miR-365-5p	KRT14
XLOC_162298	ssc-miR-365-5p	RNPS1
XLOC_220210	ssc-miR-7	DGCR6L
XLOC_165237	Ssc-miR-7	DGCR6L
ENSSSCG00000036379	Ssc-miR-7	DGCR6L
XLOC_222640	Ssc-miR-7	DGCR6L
lncRNA (upregulated)–miRNA (downregulated)–gene (upregulated) pairs
XLOC_211306	ssc-miR-34a	DHFR
XLOC_211306	ssc-miR-34a	TMEM106C
XLOC_211306	ssc-miR-34a	MLX
XLOC_100516	ssc-miR-328	NDUFA7
XLOC_100516	ssc-miR-328	RPS6KA1
XLOC_100516	ssc-miR-328	PLOD1
XLOC_100516	ssc-miR-328	CERS5
XLOC_100516	ssc-miR-328	RPUSD3
XLOC_100516	ssc-miR-328	PIM1
XLOC_100516	ssc-miR-328	FADS2
XLOC_100516	ssc-miR-328	S100A14
XLOC_100516	ssc-miR-328	ENSSSCG00000001341
XLOC_100516	ssc-miR-328	CALR
XLOC_100516	ssc-miR-328	SLC8B1
XLOC_100516	ssc-miR-328	LRRC8A
XLOC_100516	ssc-miR-328	NUMA1
XLOC_100516	ssc-miR-328	SMPD2
XLOC_100516	ssc-miR-328	SEMA4B
XLOC_000695	ssc-miR-885-3p	ETV4
XLOC_000695	ssc-miR-885-3p	TCOF1
XLOC_100516	ssc-miR-149	TCOF1
XLOC_149196	ssc-miR-149	TCOF1
XLOC_149196	ssc-miR-30c-3p	PPP4R4
XLOC_014459	ssc-miR-30c-3p	PPP4R4
ENSSSCG00000032301	ssc-miR-30b-5p	EED
XLOC_149196	ssc-miR-708-5p	PLPPR5
XLOC_149196	ssc-miR-708-5p	SON
XLOC_000695	ssc-miR-708-5p	PLPPR5
XLOC_000695	ssc-miR-708-5p	SON