Quantitative Structure Activity Relationship Studies of Topoisomerase I Inhibitors as Potent Antibreast Cancer Agents

Table 1

Structures of the indenoisoquinoline derivatives as topoisomerase I inhibitors.

Compound	R^1	R^2	R^3	R^4	Activity, GI50 (𝜇M)
1_3	–H	–NO2		–OCH3	3.24
1_4	–H	–NO2		–OCH3	0.251
1_5	–H	–NO2		–OCH3	3.31
1_35	–H	–NO2			30.9
1_38	–H	–NO2		–SMe	30.9
1_40	–H	–NO2		–H	31.6
1_41	–H	–NO2		–F	37.2
1_42	–H	–NO2		–Cl	14.8
1_43	–H	–NO2		–Br	0.282
1_49	–H	–NO2			83.2
1_50	–H	–NO2			39.8
1_53	–H	–NO2			6.03
1_56	–H	–NO2		–F	2.88
1_59	–H	–NO2		–I	34.7
1_62	–H	–NO2			0.200
1_63	–H	–NO2		–C2H5	1.55
1_64	–H	–NO2		–CH3	0.316
1_65	–H	–NO2			0.204
1_66	–H	–NO2			0.468
1_67	–H	–NO2		–H	0.123
1_68	–H	–NO2		–F	0.081
1_70	–H	–NO2		–Br	0.162
1_71	–H	–NO2		–I	0.224
1_86	–OCH3	–OCH3			13.8
1_87	–OCH3	–OCH3			37.2
1_90	–OCH3	OCH3		–F	43.7
1_94	–OCH3	OCH3			50.1
1_95	–OCH3	OCH3		–NH2	0.214
1_99	–OCH3	OCH3		–H	9.77
1_100	–OCH3	OCH3		–F	38.0
1_104	–OCH3	OCH3		–NH2	4.17
1_105	–OCH3	OCH3		–N(CH3)2	17.8
1_106	–OCH3	OCH3			1.70
1_107	–OCH3	OCH3		–C2H5	2.00
1_108	–OCH3	OCH3		–H	0.631
1_109	–OCH3	–OCH3		–F	6.03
1_110	–OCH3	–OCH3			18.2
1_111	–OCH3	–OCH3			18.6
1_112	–OCH3	–OCH3		–NO2	15.8